RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053729.13

Pdss1-201, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nlrp9bQ66X22 1003 aa30,18■■■□□ 2,42
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Hirip3Q8BLH7 601 aa30,16■■■□□ 2,42
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Egfem1Q8C088 590 aa30,15■■■□□ 2,42
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Q8C6G1 249 aa30,14■■■□□ 2,42
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Speer4aF8VPX6 267 aa30,11■■■□□ 2,41
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Atp8b2P98199 1209 aa30,09■■■□□ 2,41
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rad23bP54728 416 aa30,06■■■□□ 2,4
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kif2cQ922S8 721 aa30,06■■■□□ 2,4
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cwc27Q3TKY6 469 aa30,05■■■□□ 2,4
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP30,05■■■□□ 2,4
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Adora1Q60612 326 aa30,05■■■□□ 2,4
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa30,05■■■□□ 2,4
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Srgap3Q812A2 1099 aa30,04■■■□□ 2,4
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa30,04■■■□□ 2,4
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ttc5Q99LG4 440 aa29,96■■■□□ 2,39
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Plekho1Q9JIY0 408 aa29,96■■■□□ 2,39
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Olfr819K7N727 320 aa29,94■■■□□ 2,38
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Map3k15A2AQW0 1331 aa29,94■■■□□ 2,38
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP29,93■■■□□ 2,38
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nphp1Q9QY53 687 aa29,93■■■□□ 2,38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mmp8O70138 465 aa29,92■■■□□ 2,38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sult6b1P0CC03 303 aa29,92■■■□□ 2,38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Eya2O08575 532 aa29,91■■■□□ 2,38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gpr182P43142 395 aa29,91■■■□□ 2,38
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ftl2P49945 183 aa29,91■■■□□ 2,38
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Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cyp2c69E9PXC3 491 aa29,9■■■□□ 2,38
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