RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mterf2	Q8BKY8	385 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Otud6b	Q8K2H2	294 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rhobtb2	Q91V93	728 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tagln3	Q9R1Q8	199 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shroom2	A2ALU4	1481 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpgrip1	Q9EPQ2	1331 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dmrtb1	A2A9I7	359 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde4b	B1AWC9	736 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nhsl2	B1AXH1	854 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Magea1	O89006	320 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rad52	P43352	420 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Poli	Q6R3M4	717 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BZJ8	459 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim32	Q8CH72	655 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sf3a1	Q8K4Z5	791 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapk8	Q91Y86	384 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Thap11	Q9JJD0	305 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam155b	A2BDP1	471 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lce6a	D3YV94	81 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Akap2	O54931	893 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atf3	Q60765	181 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q6PAC4	1279 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Suz12	Q80U70	741 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cfap69	Q8BH53	942 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgd2	Q8BY35	655 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sulf1	Q8K007	870 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erbb3	Q61526	1339 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp2c68	K7N6C2	491 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ercc3	P49135	783 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dhx37	Q6NZL1	1150 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nim1k	Q8BHI9	436 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eml3	Q8VC03	897 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhb16	Q91Y03	802 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rlbp1	Q9Z275	317 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnq2	Q9Z351	759 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Acin1	Q9JIX8	1338 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem238l	A0A1B0GS74	79 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Uprt	B1AVZ0	310 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anp32a	O35381	247 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rb1	P13405	921 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddit3	P35639	168 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smpd1	Q04519	627 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pick1	Q62083	416 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mlec	Q6ZQI3	291 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Larp6	Q8BN59	492 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Frmd6	Q8C0V9	622 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map2k7	Q8CE90	535 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Capn12	Q9ER56	720 aa		5	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ncapg	E9PWG6	1004 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Thap8	E9Q695	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif4	P33174	1231 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dsc3	P55850	896 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif5	P59325	429 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sycp3	P70281	254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lamc2	Q61092	1191 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chtf18	Q8BIW9	969 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf131	Q8K3J5	619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd248	Q91V98	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plpp7	Q91WB2	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q922M7	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Icmt	Q9EQK7	283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Utp3	Q9JI13	469 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aatf	Q9JKX4	526 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nubp1	Q9R060	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chkb	O55229	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab33a	P97950	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrfn1	Q2WF71	766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmed1	Q3V009	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd40	Q5SUE8	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Large2	Q5XPT3	690 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcna6	Q61923	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Epb41l5	Q8BGS1	731 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Osgep	Q8BWU5	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Yipf4	Q8C407	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ngef	Q8CHT1	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fancl	Q9CR14	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Polk	Q9QUG2	852 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Taf4b	G5E8Z2	855 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nub1	P54729	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sec1	P97353	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rtkn2	Q14B46	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc61	Q3UJV1	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cracr2a	Q3UP38	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Strip2	Q8C9H6	844 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trmt6	Q8CE96	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp3	Q91W36	520 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rassf1	Q99MK9	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mta2	Q9R190	668 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp277	E9Q6D6	583 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8257	E9Q8R3	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grem1	O70326	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igflr1	Q3U4N7	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cfap161	Q6P8Y0	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abtb2	Q7TQI7	1024 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mta1	Q8K4B0	715 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnc4	Q8R1C0	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cabp4	Q8VHC5	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hdac9	Q99N13	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chmp3	Q9CQ10	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11939	A2A592	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.5 ms