Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,95■■■■■ 4,31
Larp6Q8BN59 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Larp6Q8BN59 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Larp6Q8BN59 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Larp6Q8BN59 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Larp6Q8BN59 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Larp6Q8BN59 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,09■■■■□ 3,53
Larp6Q8BN59 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Larp6Q8BN59 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Larp6Q8BN59 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
Larp6Q8BN59 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Larp6Q8BN59 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Larp6Q8BN59 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Larp6Q8BN59 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Larp6Q8BN59 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Larp6Q8BN59 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Larp6Q8BN59 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Larp6Q8BN59 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Larp6Q8BN59 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Larp6Q8BN59 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Larp6Q8BN59 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
Larp6Q8BN59 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Larp6Q8BN59 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Larp6Q8BN59 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Larp6Q8BN59 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Larp6Q8BN59 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Larp6Q8BN59 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Larp6Q8BN59 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Larp6Q8BN59 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Larp6Q8BN59 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Larp6Q8BN59 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Larp6Q8BN59 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Larp6Q8BN59 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Larp6Q8BN59 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Larp6Q8BN59 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Larp6Q8BN59 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,96
Larp6Q8BN59 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Larp6Q8BN59 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Larp6Q8BN59 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Larp6Q8BN59 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Larp6Q8BN59 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Larp6Q8BN59 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Larp6Q8BN59 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Larp6Q8BN59 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Larp6Q8BN59 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Larp6Q8BN59 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Larp6Q8BN59 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Larp6Q8BN59 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Larp6Q8BN59 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Larp6Q8BN59 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Larp6Q8BN59 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Larp6Q8BN59 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Larp6Q8BN59 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Larp6Q8BN59 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Larp6Q8BN59 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Larp6Q8BN59 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Larp6Q8BN59 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Larp6Q8BN59 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Larp6Q8BN59 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Larp6Q8BN59 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Larp6Q8BN59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,6■■■□□ 2,81
Larp6Q8BN59 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
Larp6Q8BN59 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Larp6Q8BN59 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Larp6Q8BN59 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Larp6Q8BN59 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Larp6Q8BN59 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Larp6Q8BN59 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Larp6Q8BN59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Larp6Q8BN59 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Larp6Q8BN59 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Larp6Q8BN59 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Larp6Q8BN59 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Larp6Q8BN59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Larp6Q8BN59 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Larp6Q8BN59 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Larp6Q8BN59 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Larp6Q8BN59 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Larp6Q8BN59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Larp6Q8BN59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Larp6Q8BN59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Larp6Q8BN59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Larp6Q8BN59 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Larp6Q8BN59 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Larp6Q8BN59 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Larp6Q8BN59 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Larp6Q8BN59 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Larp6Q8BN59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Larp6Q8BN59 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Larp6Q8BN59 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Larp6Q8BN59 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Larp6Q8BN59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Larp6Q8BN59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Larp6Q8BN59 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
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