Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q8

Tagln3, Transgelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tagln3Q9R1Q8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Tagln3Q9R1Q8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,7
Tagln3Q9R1Q8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Tagln3Q9R1Q8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Tagln3Q9R1Q8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Tagln3Q9R1Q8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Tagln3Q9R1Q8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Tagln3Q9R1Q8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Tagln3Q9R1Q8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Tagln3Q9R1Q8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Tagln3Q9R1Q8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Tagln3Q9R1Q8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tagln3Q9R1Q8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tagln3Q9R1Q8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Tagln3Q9R1Q8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Tagln3Q9R1Q8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tagln3Q9R1Q8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Tagln3Q9R1Q8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tagln3Q9R1Q8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Tagln3Q9R1Q8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Tagln3Q9R1Q8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tagln3Q9R1Q8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tagln3Q9R1Q8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tagln3Q9R1Q8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tagln3Q9R1Q8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tagln3Q9R1Q8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tagln3Q9R1Q8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tagln3Q9R1Q8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Tagln3Q9R1Q8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tagln3Q9R1Q8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tagln3Q9R1Q8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tagln3Q9R1Q8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tagln3Q9R1Q8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Tagln3Q9R1Q8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Tagln3Q9R1Q8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Tagln3Q9R1Q8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Tagln3Q9R1Q8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Tagln3Q9R1Q8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Tagln3Q9R1Q8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Tagln3Q9R1Q8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Tagln3Q9R1Q8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Tagln3Q9R1Q8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Tagln3Q9R1Q8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Tagln3Q9R1Q8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Tagln3Q9R1Q8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Tagln3Q9R1Q8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tagln3Q9R1Q8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Tagln3Q9R1Q8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Tagln3Q9R1Q8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Tagln3Q9R1Q8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Tagln3Q9R1Q8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tagln3Q9R1Q8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tagln3Q9R1Q8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tagln3Q9R1Q8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Tagln3Q9R1Q8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tagln3Q9R1Q8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tagln3Q9R1Q8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tagln3Q9R1Q8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tagln3Q9R1Q8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,92
Tagln3Q9R1Q8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tagln3Q9R1Q8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tagln3Q9R1Q8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tagln3Q9R1Q8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tagln3Q9R1Q8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tagln3Q9R1Q8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tagln3Q9R1Q8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Tagln3Q9R1Q8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tagln3Q9R1Q8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tagln3Q9R1Q8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Tagln3Q9R1Q8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Tagln3Q9R1Q8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tagln3Q9R1Q8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,88
Tagln3Q9R1Q8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tagln3Q9R1Q8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tagln3Q9R1Q8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tagln3Q9R1Q8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tagln3Q9R1Q8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tagln3Q9R1Q8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tagln3Q9R1Q8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Tagln3Q9R1Q8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tagln3Q9R1Q8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tagln3Q9R1Q8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tagln3Q9R1Q8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tagln3Q9R1Q8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tagln3Q9R1Q8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tagln3Q9R1Q8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tagln3Q9R1Q8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tagln3Q9R1Q8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tagln3Q9R1Q8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Tagln3Q9R1Q8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Tagln3Q9R1Q8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Tagln3Q9R1Q8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tagln3Q9R1Q8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Tagln3Q9R1Q8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tagln3Q9R1Q8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tagln3Q9R1Q8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tagln3Q9R1Q8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tagln3Q9R1Q8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tagln3Q9R1Q8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tagln3Q9R1Q8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms