Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Rab33aP97950 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rab33aP97950 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rab33aP97950 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Rab33aP97950 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rab33aP97950 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rab33aP97950 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rab33aP97950 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rab33aP97950 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rab33aP97950 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rab33aP97950 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rab33aP97950 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rab33aP97950 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rab33aP97950 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rab33aP97950 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rab33aP97950 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rab33aP97950 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rab33aP97950 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rab33aP97950 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rab33aP97950 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Rab33aP97950 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rab33aP97950 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rab33aP97950 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rab33aP97950 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rab33aP97950 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rab33aP97950 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rab33aP97950 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rab33aP97950 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rab33aP97950 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rab33aP97950 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rab33aP97950 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rab33aP97950 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Rab33aP97950 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Rab33aP97950 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rab33aP97950 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rab33aP97950 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rab33aP97950 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Rab33aP97950 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rab33aP97950 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rab33aP97950 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rab33aP97950 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rab33aP97950 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rab33aP97950 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rab33aP97950 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rab33aP97950 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rab33aP97950 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rab33aP97950 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rab33aP97950 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rab33aP97950 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rab33aP97950 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rab33aP97950 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rab33aP97950 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Rab33aP97950 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab33aP97950 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rab33aP97950 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rab33aP97950 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rab33aP97950 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rab33aP97950 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rab33aP97950 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rab33aP97950 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab33aP97950 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab33aP97950 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rab33aP97950 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rab33aP97950 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rab33aP97950 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rab33aP97950 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rab33aP97950 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rab33aP97950 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rab33aP97950 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rab33aP97950 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rab33aP97950 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rab33aP97950 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rab33aP97950 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rab33aP97950 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rab33aP97950 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab33aP97950 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab33aP97950 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab33aP97950 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab33aP97950 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab33aP97950 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab33aP97950 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab33aP97950 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab33aP97950 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab33aP97950 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab33aP97950 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab33aP97950 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rab33aP97950 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab33aP97950 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab33aP97950 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab33aP97950 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab33aP97950 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab33aP97950 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab33aP97950 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab33aP97950 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab33aP97950 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab33aP97950 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab33aP97950 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab33aP97950 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab33aP97950 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab33aP97950 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms