Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,9■■■■□ 3,98
Rab33aP97950 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Rab33aP97950 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Rab33aP97950 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,82■■■■□ 3,16
Rab33aP97950 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Rab33aP97950 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Rab33aP97950 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Rab33aP97950 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Rab33aP97950 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Rab33aP97950 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Rab33aP97950 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Rab33aP97950 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Rab33aP97950 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Rab33aP97950 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rab33aP97950 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Rab33aP97950 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,26■■■□□ 2,75
Rab33aP97950 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Rab33aP97950 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Rab33aP97950 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Rab33aP97950 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
Rab33aP97950 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Rab33aP97950 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Rab33aP97950 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Rab33aP97950 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Rab33aP97950 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Rab33aP97950 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Rab33aP97950 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Rab33aP97950 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Rab33aP97950 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Rab33aP97950 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Rab33aP97950 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Rab33aP97950 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Rab33aP97950 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,45■■■□□ 2,63
Rab33aP97950 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Rab33aP97950 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Rab33aP97950 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Rab33aP97950 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Rab33aP97950 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Rab33aP97950 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rab33aP97950 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Rab33aP97950 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Rab33aP97950 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rab33aP97950 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Rab33aP97950 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rab33aP97950 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Rab33aP97950 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Rab33aP97950 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rab33aP97950 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rab33aP97950 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rab33aP97950 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rab33aP97950 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rab33aP97950 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Rab33aP97950 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Rab33aP97950 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Rab33aP97950 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rab33aP97950 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rab33aP97950 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Rab33aP97950 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Rab33aP97950 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Rab33aP97950 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rab33aP97950 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rab33aP97950 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rab33aP97950 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Rab33aP97950 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rab33aP97950 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rab33aP97950 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rab33aP97950 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rab33aP97950 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rab33aP97950 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rab33aP97950 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rab33aP97950 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Rab33aP97950 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Rab33aP97950 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rab33aP97950 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rab33aP97950 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rab33aP97950 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rab33aP97950 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rab33aP97950 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Rab33aP97950 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rab33aP97950 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rab33aP97950 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rab33aP97950 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Rab33aP97950 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rab33aP97950 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rab33aP97950 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Rab33aP97950 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Rab33aP97950 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rab33aP97950 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Rab33aP97950 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rab33aP97950 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rab33aP97950 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rab33aP97950 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Rab33aP97950 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rab33aP97950 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Rab33aP97950 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Rab33aP97950 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Rab33aP97950 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Rab33aP97950 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rab33aP97950 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Rab33aP97950 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms