RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CalcrlQ9R1W5 463 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rab25Q9WTL2 213 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr727A2RTN7 324 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mllt6B1AR10 1109 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sult6b2B7ZWN4 290 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Actc1P68033 377 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Acta1P68134 377 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxb13P70321 286 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snx33Q4VAA7 574 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr320Q7TRZ4 306 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Coro2bQ8BH44 480 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cacng6Q8VHW3 260 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eef1e1Q9D1M4 174 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snx20Q9D2Y5 313 aa16.03■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mier2Q3U3N0 541 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc26a10Q5EBI0 492 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ToxQ66JW3 526 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BR90 294 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cml2Q8CHQ9 238 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr516Q8VFZ5 314 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Timm22Q9CQ85 194 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr73Q9CWR1 371 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adam21Q9JI76 729 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PnckQ9QYK9 343 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hs3st4D3YVV6 449 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr318Q5NCD7 306 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arhgef39Q66JY6 344 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Moxd1Q9CXI3 613 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trpv4Q9EPK8 871 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lamb1P02469 1786 aa16.02■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm10800D3Z496 220 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp989H3BLB0 661 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r42O35192 852 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Galr2O88854 371 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm5571P01639 130 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P03987 398 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdh11P55288 796 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Polr2iP60898 125 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adam5Q3TTE0 751 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm813Q3UWK9 176 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prps1l1Q8C5R8 318 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb20Q8K0L9 741 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Isoc2bQ9DCC7 210 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P04214 136 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Drd2P61168 444 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sox9Q04887 507 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TifaQ793I8 184 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zc3h14Q8BJ05 735 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lancl3Q8CD19 420 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r234Q8R298 329 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AjubaQ91XC0 547 aa16.02■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1206A2ATJ9 307 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H60cB1B213 197 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gmeb2P58929 530 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 N6amt1Q6SKR2 214 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SnupnQ80W37 358 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm10330Q8BKS1 112 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cpne5Q8JZW4 593 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1094Q8VF13 330 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf24Q91VN1 368 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc25a27Q9D6D0 322 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm11397F6V5V4 377 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dusp5Q1HL35 384 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mtcp1Q60945 107 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Shc4Q6S5L9 626 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Itih5Q8BJD1 952 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dlec1Q8BLA1 635 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdkl3Q8BLF2 595 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BPC6 396 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmed4Q8R1V4 227 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zmynd11Q8R5C8 602 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lipt1Q8VCM4 373 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpinb7Q9D695 380 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dennd6bQ9D9V7 585 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Asic5Q9R0Y1 495 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cacna1bO55017 2327 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Btbd35f16A0A087WSN2 498 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm2022A0A1Y7VLT7 144 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm12695A2AGB2 545 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 5430401F13RikE9Q328 175 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GuloP58710 440 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scgb1a1Q06318 96 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fbxw18Q3TSA9 469 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P2rx3Q3UR32 397 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Polr2mQ6P6I6 366 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RgmaQ6PCX7 454 aa16.01■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hmbox1Q8BJA3 419 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.2 ms