Protein–RNA interactions for Protein: Q60945

Mtcp1, Protein p13 MTCP-1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcp1Q60945 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Mtcp1Q60945 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Mtcp1Q60945 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mtcp1Q60945 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Mtcp1Q60945 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Mtcp1Q60945 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Mtcp1Q60945 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Mtcp1Q60945 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Mtcp1Q60945 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Mtcp1Q60945 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Mtcp1Q60945 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Mtcp1Q60945 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Mtcp1Q60945 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Mtcp1Q60945 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Mtcp1Q60945 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Mtcp1Q60945 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Mtcp1Q60945 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Mtcp1Q60945 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Mtcp1Q60945 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Mtcp1Q60945 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Mtcp1Q60945 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Mtcp1Q60945 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Mtcp1Q60945 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Mtcp1Q60945 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Mtcp1Q60945 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Mtcp1Q60945 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Mtcp1Q60945 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Mtcp1Q60945 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Mtcp1Q60945 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Mtcp1Q60945 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Mtcp1Q60945 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Mtcp1Q60945 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Mtcp1Q60945 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Mtcp1Q60945 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Mtcp1Q60945 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Mtcp1Q60945 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Mtcp1Q60945 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Mtcp1Q60945 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Mtcp1Q60945 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Mtcp1Q60945 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Mtcp1Q60945 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Mtcp1Q60945 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Mtcp1Q60945 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Mtcp1Q60945 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Mtcp1Q60945 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Mtcp1Q60945 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Mtcp1Q60945 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Mtcp1Q60945 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Mtcp1Q60945 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Mtcp1Q60945 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Mtcp1Q60945 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Mtcp1Q60945 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Mtcp1Q60945 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Mtcp1Q60945 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Mtcp1Q60945 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Mtcp1Q60945 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Mtcp1Q60945 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Mtcp1Q60945 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Mtcp1Q60945 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Mtcp1Q60945 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Mtcp1Q60945 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Mtcp1Q60945 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Mtcp1Q60945 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Mtcp1Q60945 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Mtcp1Q60945 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Mtcp1Q60945 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Mtcp1Q60945 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Mtcp1Q60945 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Mtcp1Q60945 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Mtcp1Q60945 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Mtcp1Q60945 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Mtcp1Q60945 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Mtcp1Q60945 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Mtcp1Q60945 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Mtcp1Q60945 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Mtcp1Q60945 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Mtcp1Q60945 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Mtcp1Q60945 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Mtcp1Q60945 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Mtcp1Q60945 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Mtcp1Q60945 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Mtcp1Q60945 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Mtcp1Q60945 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Mtcp1Q60945 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Mtcp1Q60945 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Mtcp1Q60945 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Mtcp1Q60945 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Mtcp1Q60945 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Mtcp1Q60945 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Mtcp1Q60945 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Mtcp1Q60945 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Mtcp1Q60945 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Mtcp1Q60945 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms