Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Rab25Q9WTL2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rab25Q9WTL2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rab25Q9WTL2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Rab25Q9WTL2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rab25Q9WTL2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Rab25Q9WTL2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Rab25Q9WTL2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rab25Q9WTL2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rab25Q9WTL2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab25Q9WTL2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rab25Q9WTL2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Rab25Q9WTL2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rab25Q9WTL2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rab25Q9WTL2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rab25Q9WTL2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rab25Q9WTL2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Rab25Q9WTL2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Rab25Q9WTL2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Rab25Q9WTL2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rab25Q9WTL2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab25Q9WTL2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rab25Q9WTL2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rab25Q9WTL2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rab25Q9WTL2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rab25Q9WTL2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rab25Q9WTL2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rab25Q9WTL2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rab25Q9WTL2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rab25Q9WTL2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rab25Q9WTL2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rab25Q9WTL2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
Rab25Q9WTL2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rab25Q9WTL2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rab25Q9WTL2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rab25Q9WTL2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab25Q9WTL2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Rab25Q9WTL2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Rab25Q9WTL2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rab25Q9WTL2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rab25Q9WTL2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Rab25Q9WTL2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rab25Q9WTL2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rab25Q9WTL2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Rab25Q9WTL2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Rab25Q9WTL2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Rab25Q9WTL2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rab25Q9WTL2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Rab25Q9WTL2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rab25Q9WTL2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rab25Q9WTL2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rab25Q9WTL2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rab25Q9WTL2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Rab25Q9WTL2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Rab25Q9WTL2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Rab25Q9WTL2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Rab25Q9WTL2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab25Q9WTL2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Rab25Q9WTL2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Rab25Q9WTL2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Rab25Q9WTL2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Rab25Q9WTL2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Rab25Q9WTL2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Rab25Q9WTL2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Rab25Q9WTL2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Rab25Q9WTL2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Rab25Q9WTL2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Rab25Q9WTL2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rab25Q9WTL2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rab25Q9WTL2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Rab25Q9WTL2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Rab25Q9WTL2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rab25Q9WTL2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Rab25Q9WTL2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Rab25Q9WTL2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Rab25Q9WTL2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rab25Q9WTL2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rab25Q9WTL2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rab25Q9WTL2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Rab25Q9WTL2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Rab25Q9WTL2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Rab25Q9WTL2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Rab25Q9WTL2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Rab25Q9WTL2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rab25Q9WTL2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,5■■□□□ 1,35
Rab25Q9WTL2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rab25Q9WTL2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Rab25Q9WTL2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Rab25Q9WTL2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Rab25Q9WTL2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rab25Q9WTL2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rab25Q9WTL2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Rab25Q9WTL2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Rab25Q9WTL2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rab25Q9WTL2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rab25Q9WTL2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rab25Q9WTL2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rab25Q9WTL2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rab25Q9WTL2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Rab25Q9WTL2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms