Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rab25Q9WTL2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab25Q9WTL2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab25Q9WTL2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab25Q9WTL2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab25Q9WTL2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab25Q9WTL2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab25Q9WTL2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab25Q9WTL2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab25Q9WTL2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab25Q9WTL2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab25Q9WTL2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rab25Q9WTL2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab25Q9WTL2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab25Q9WTL2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab25Q9WTL2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab25Q9WTL2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab25Q9WTL2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab25Q9WTL2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab25Q9WTL2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab25Q9WTL2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab25Q9WTL2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab25Q9WTL2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab25Q9WTL2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab25Q9WTL2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab25Q9WTL2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab25Q9WTL2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab25Q9WTL2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab25Q9WTL2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab25Q9WTL2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab25Q9WTL2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab25Q9WTL2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab25Q9WTL2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab25Q9WTL2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab25Q9WTL2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab25Q9WTL2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab25Q9WTL2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab25Q9WTL2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab25Q9WTL2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab25Q9WTL2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab25Q9WTL2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab25Q9WTL2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab25Q9WTL2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab25Q9WTL2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab25Q9WTL2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab25Q9WTL2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab25Q9WTL2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab25Q9WTL2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab25Q9WTL2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab25Q9WTL2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab25Q9WTL2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab25Q9WTL2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab25Q9WTL2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab25Q9WTL2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab25Q9WTL2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab25Q9WTL2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab25Q9WTL2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab25Q9WTL2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab25Q9WTL2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab25Q9WTL2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab25Q9WTL2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab25Q9WTL2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab25Q9WTL2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab25Q9WTL2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab25Q9WTL2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab25Q9WTL2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab25Q9WTL2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab25Q9WTL2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab25Q9WTL2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab25Q9WTL2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab25Q9WTL2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab25Q9WTL2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab25Q9WTL2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab25Q9WTL2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab25Q9WTL2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab25Q9WTL2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab25Q9WTL2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab25Q9WTL2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab25Q9WTL2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab25Q9WTL2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab25Q9WTL2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab25Q9WTL2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab25Q9WTL2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab25Q9WTL2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab25Q9WTL2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab25Q9WTL2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab25Q9WTL2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab25Q9WTL2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab25Q9WTL2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab25Q9WTL2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab25Q9WTL2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab25Q9WTL2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab25Q9WTL2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab25Q9WTL2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab25Q9WTL2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab25Q9WTL2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab25Q9WTL2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab25Q9WTL2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab25Q9WTL2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab25Q9WTL2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms