Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
P03987 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
P03987 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
P03987 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
P03987 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
P03987 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
P03987 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
P03987 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
P03987 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
P03987 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
P03987 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
P03987 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P03987 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
P03987 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
P03987 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
P03987 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
P03987 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
P03987 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
P03987 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
P03987 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
P03987 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
P03987 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
P03987 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
P03987 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
P03987 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P03987 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P03987 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
P03987 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P03987 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
P03987 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P03987 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
P03987 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P03987 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P03987 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
P03987 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
P03987 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
P03987 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P03987 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
P03987 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P03987 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P03987 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P03987 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
P03987 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P03987 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
P03987 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P03987 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
P03987 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P03987 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P03987 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
P03987 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P03987 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P03987 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P03987 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
P03987 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
P03987 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
P03987 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P03987 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P03987 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
P03987 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P03987 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P03987 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
P03987 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P03987 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P03987 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
P03987 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
P03987 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
P03987 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
P03987 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P03987 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P03987 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P03987 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P03987 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P03987 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P03987 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
P03987 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P03987 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P03987 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P03987 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P03987 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P03987 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P03987 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P03987 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
P03987 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P03987 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
P03987 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P03987 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P03987 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P03987 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P03987 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P03987 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P03987 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
P03987 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P03987 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P03987 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
P03987 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P03987 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P03987 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P03987 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P03987 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
P03987 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms