Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Eef1e1Q9D1M4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Eef1e1Q9D1M4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Eef1e1Q9D1M4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Eef1e1Q9D1M4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Eef1e1Q9D1M4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Eef1e1Q9D1M4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Eef1e1Q9D1M4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eef1e1Q9D1M4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Eef1e1Q9D1M4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Eef1e1Q9D1M4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Eef1e1Q9D1M4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eef1e1Q9D1M4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eef1e1Q9D1M4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eef1e1Q9D1M4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eef1e1Q9D1M4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Eef1e1Q9D1M4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eef1e1Q9D1M4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eef1e1Q9D1M4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Eef1e1Q9D1M4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eef1e1Q9D1M4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Eef1e1Q9D1M4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eef1e1Q9D1M4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Eef1e1Q9D1M4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eef1e1Q9D1M4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eef1e1Q9D1M4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eef1e1Q9D1M4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eef1e1Q9D1M4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Eef1e1Q9D1M4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eef1e1Q9D1M4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Eef1e1Q9D1M4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eef1e1Q9D1M4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eef1e1Q9D1M4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eef1e1Q9D1M4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Eef1e1Q9D1M4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eef1e1Q9D1M4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eef1e1Q9D1M4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eef1e1Q9D1M4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eef1e1Q9D1M4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Eef1e1Q9D1M4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eef1e1Q9D1M4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eef1e1Q9D1M4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eef1e1Q9D1M4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eef1e1Q9D1M4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eef1e1Q9D1M4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eef1e1Q9D1M4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Eef1e1Q9D1M4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eef1e1Q9D1M4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eef1e1Q9D1M4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eef1e1Q9D1M4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eef1e1Q9D1M4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eef1e1Q9D1M4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eef1e1Q9D1M4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eef1e1Q9D1M4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Eef1e1Q9D1M4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eef1e1Q9D1M4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eef1e1Q9D1M4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eef1e1Q9D1M4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eef1e1Q9D1M4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eef1e1Q9D1M4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eef1e1Q9D1M4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eef1e1Q9D1M4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eef1e1Q9D1M4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eef1e1Q9D1M4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eef1e1Q9D1M4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eef1e1Q9D1M4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eef1e1Q9D1M4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eef1e1Q9D1M4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eef1e1Q9D1M4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eef1e1Q9D1M4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Eef1e1Q9D1M4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eef1e1Q9D1M4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Eef1e1Q9D1M4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eef1e1Q9D1M4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eef1e1Q9D1M4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eef1e1Q9D1M4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eef1e1Q9D1M4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eef1e1Q9D1M4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eef1e1Q9D1M4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Eef1e1Q9D1M4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eef1e1Q9D1M4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eef1e1Q9D1M4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eef1e1Q9D1M4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eef1e1Q9D1M4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eef1e1Q9D1M4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eef1e1Q9D1M4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eef1e1Q9D1M4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eef1e1Q9D1M4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eef1e1Q9D1M4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eef1e1Q9D1M4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eef1e1Q9D1M4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eef1e1Q9D1M4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eef1e1Q9D1M4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eef1e1Q9D1M4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eef1e1Q9D1M4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eef1e1Q9D1M4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eef1e1Q9D1M4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eef1e1Q9D1M4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eef1e1Q9D1M4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eef1e1Q9D1M4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms