RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 WDR41Q9HAD4 459 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 THEGQ9P2T0 379 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CD300AQ9UGN4 299 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 AP4S1Q9Y587 144 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CITO14578 2027 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0G2JMZ2 1700 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC37A2A6NM11 1700 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MAGEB16A2A368 324 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM64BA6NI03 449 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DLGAP1O14490 977 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SOCS3O14543 225 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HCRTO43612 131 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TIMM44O43615 452 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PFDN1O60925 122 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TADA2AO75478 443 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SLC25A12O75746 678 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DDHD2O94830 711 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 VAPBO95292 243 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 H6PDO95479 791 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 C22orf31O95567 290 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 AP2A1O95782 977 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PGK1P00558 417 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 APOA4P06727 396 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PTPN3P26045 913 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NMBRP28336 390 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HSPA1LP34931 641 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HADHAP40939 763 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HCAR3P49019 387 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NAGLUP54802 743 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJB13P59910 316 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 COX10Q12887 443 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GAGE2BQ13066 116 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ART3Q13508 389 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 KYAT1Q16773 422 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZBED5Q49AG3 693 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GAGE2EQ4V326 116 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CNSTQ6PJW8 725 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PID1Q7Z2X4 250 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 KCNMB4Q86W47 210 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 UNC93AQ86WB7 457 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 FAM131BQ86XD5 332 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DEFB106AQ8N104 65 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC43Q8N309 656 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ANKFN1Q8N957 763 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 FAM110BQ8TC76 370 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 FNDC8Q8TC99 324 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 AGR3Q8TD06 166 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RNF139Q8WU17 664 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HSD17B8Q92506 261 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SUSD6Q92537 303 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TOP1MTQ969P6 601 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NT5C3BQ969T7 300 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NXNL1Q96CM4 212 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 VPS39Q96JC1 886 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NPY6RQ99463 290 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GPR22Q99680 433 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms