RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LHX9Q9NQ69 397 aa9.54□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 STARD5Q9NSY2 213 aa9.54□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.54□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 HAAOP46952 286 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RAB28P51157 221 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DUSP2Q05923 314 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C1orf61Q13536 156 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PIK3R3Q92569 461 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZG16BQ96DA0 208 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 COL6A3P12111 3177 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FRYLO94915 3013 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CCNB2O95067 398 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LAMP2P13473 410 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ALAS2P22557 587 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 UQCRC2P22695 453 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CD6P30203 668 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CNR2P34972 360 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MAPK9P45984 424 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SLC35A2P78381 396 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB134Q4QY38 66 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RAB43Q86YS6 212 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 APH1BQ8WW43 257 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SLC9A6Q92581 669 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR5K4A6NMS3 321 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 K7EQS6 105 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 AKR7A2O43488 359 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 DNAJB6O75190 326 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ASGR2P07307 311 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 IL1RNP18510 177 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C5AR1P21730 350 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 GRK5P34947 590 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 AVPR1BP47901 424 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ST3GAL4Q11206 333 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RAB7BQ96AH8 199 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PIP5K1AQ99755 562 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 APOOQ9BUR5 198 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 ACER3Q9NUN7 267 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 PLXNA2O75051 1894 aa9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM64BA6NI03 449 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CLDN24A6NM45 220 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CH25HO95992 272 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ITGAMP11215 1152 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 RYKP34925 604 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MC3RP41968 323 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ADPRHP54922 357 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 RHAGQ02094 409 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 HYAL1Q12794 435 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MAP4K2Q12851 820 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms