RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	YHL012W	P38709	493 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	GEM1	P39722	662 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	FCY21	P40039	528 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	PEX14	P53112	341 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	MDR1	P53258	950 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YAF9	P53930	226 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	TAF12	Q03761	539 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	DON1	Q05610	365 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	AIM7	Q12156	149 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ATP16	Q12165	160 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	BUG1	Q12191	341 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	WSC3	Q12215	556 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	BBP1	Q12365	385 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SPS1	P08458	490 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	PMA2	P19657	947 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	APL1	P27351	700 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	KIC1	P38692	1080 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	VMA22	P38784	181 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	STB2	P46679	850 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ISM1	P48526	1002 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ALT1	P52893	592 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SPO1	P53541	631 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	RCM1	P53972	490 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	TFB2	Q02939	513 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SCM3	Q12334	223 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	DPH6	Q12429	685 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ENT1	Q12518	454 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	BPT1	P14772	1559 aa		5.46	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	POL4	P25615	582 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MEI4	P29467	408 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	RAD54	P32863	898 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.46	□□□□□ -1.54	not detected
EXO1	YOR033C	FES1	P38260	290 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MBP1	P39678	833 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	VTC2	P43585	828 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	TRS85	P46944	698 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	GCV2	P49095	1034 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YNL144C	P53907	740 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	SGD1	Q06132	899 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MCM21	Q06675	368 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MSH5	Q12175	901 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	HTA2	P04912	132 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	PHO3	P24031	467 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	AFG2	P32794	780 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MNN2	P38069	597 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	DYS1	P38791	387 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	FMP10	P40098	244 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	GNP1	P48813	663 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	RSM24	Q03976	319 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	IRC3	Q06683	689 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	PSK1	P31374	1356 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	XRS2	P33301	854 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	PIK1	P39104	1066 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MET10	P39692	1035 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	MRX1	P40050	688 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	SAP185	P40856	1058 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YGL176C	P46945	554 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	STB4	P50104	949 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	ATF2	P53296	535 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	RAD33	Q04231	177 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	CTI6	Q08923	506 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	HIR3	P47171	1648 aa		5.45	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	ATE1	P16639	503 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	RPO26	P20435	155 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	SET3	P36124	751 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	CCL1	P37366	393 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YJR079W	P47126	109 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	YNL108C	P53929	270 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	TAF11	Q04226	346 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	OCA6	Q12454	224 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	RPC53	P25441	422 aa		5.44	□□□□□ -1.54
EXO1	YOR033C	KIP2	P28743	706 aa		5.44	□□□□□ -1.54

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