RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	TMT1	P32643	299 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	PPS1	P38148	807 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	JHD1	P40034	492 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	SEC5	P89102	971 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	WHI2	P12611	486 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	CDC15	P27636	974 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	TOF1	P53840	1238 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	YDL057W	Q07379	328 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	DPH2	P32461	534 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	YNL146W	P53906	100 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	OSW2	Q12202	724 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	YSC83	P32792	385 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	CIR1	P42940	261 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	TPO2	P53283	614 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	CUR1	Q06469	252 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	UBR2	Q07963	1872 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN5	YLR141W	PCK1	P10963	549 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	RPC53	P25441	422 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	VPS35	P34110	944 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	UBP13	P38187	747 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	GCV2	P49095	1034 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YPL277C	Q08989	487 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	KEX1	P09620	729 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	MNN4	P36044	1178 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	UBX7	P38349	436 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YFL034W	P43564	1073 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YPT11	P48559	417 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	TAM41	P53230	385 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YDR090C	Q03193	310 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	PCD1	Q12524	340 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	BUD2	P33314	1104 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YAP1801	P38856	637 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	HAP5	Q02516	242 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	APC11	Q12157	165 aa		15.93	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	GPA1	P08539	472 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	DAL7	P21826	554 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	CUL3	P53202	744 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	ENV11	P53246	860 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	SKY1	Q03656	742 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	ECM7	Q06200	448 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YEL1	P34225	687 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	SLX1	P38324	304 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YER130C	P39959	443 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	DJP1	P40564	432 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	VTC3	Q02725	835 aa		15.91	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.9	■□□□□ 0.14	not detected
RRN5	YLR141W	MRX3	P38172	270 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	YHL026C	P38740	315 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	TLG2	Q08144	397 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN5	YLR141W	VID24	P38263	362 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	OPT1	P40897	799 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	HUL4	P40985	892 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	LAM5	P43560	674 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	COX4	P04037	155 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	PHO8	P11491	566 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	GLN3	P18494	730 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	BIM1	P40013	344 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	TCO89	Q08921	799 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	ZPS1	Q12512	249 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	AIM44	Q99299	758 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	TRK2	P28584	889 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	VID30	P53076	958 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	TRS130	Q03660	1102 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	YLR455W	Q06188	304 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	ORC5	P50874	479 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	SHE10	P53075	577 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	YPL216W	Q08964	1102 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	ALT2	P52892	507 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	TRS33	Q99394	268 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	MED1	Q12321	566 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN5	YLR141W	ESL1	P40456	1118 aa		15.83	■□□□□ 0.12

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