RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 HLFQ16534 295 aa25.93■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 NGEFQ8N5V2 710 aa25.93■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP98P52948 1817 aa25.93■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.92■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 CHRNA5P30532 468 aa25.92■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 GNAI1P63096 354 aa25.92■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.92■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.92■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.91■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.91■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 HOXB7P09629 217 aa25.91■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 PROSER3Q2NL68 480 aa25.91■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 WWC1Q8IX03 1113 aa25.9■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 PIM2Q9P1W9 311 aa25.9■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.89■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 BCS1LQ9Y276 419 aa25.89■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 ANXA1P04083 346 aa25.88■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.88■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 CNBD1Q8NA66 436 aa25.88■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 NECTIN2Q92692 538 aa25.88■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.87■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.87■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP10DQ9P241 1426 aa25.87■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.86■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.86■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.85■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.85■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.84■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.84■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 PDE6BP35913 854 aa25.83■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 ST5P78524 1137 aa25.83■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 IL16Q14005 1332 aa25.83■■□□□ 1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 H0YIN7 160 aa25.82■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 COPS6Q7L5N1 327 aa25.82■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.82■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.81■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.81■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.81■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.81■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 NPHP1O15259 732 aa25.8■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.8■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.79■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 TTLL6Q8N841 843 aa25.78■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 ADCY9O60503 1353 aa25.78■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM177BA6PVY3 158 aa25.77■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 GPTP24298 496 aa25.77■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.77■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR63Q8IWG1 891 aa25.77■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 SRGNP10124 158 aa25.76■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 SUSD4Q5VX71 490 aa25.76■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 TSPYL6Q8N831 410 aa25.76■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 NYXQ9GZU5 481 aa25.76■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 HYPKQ9NX55 129 aa25.76■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.75■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC12Q96J65 1359 aa25.74■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 STYK1Q6J9G0 422 aa25.74■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.712e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2-217ENST00000590124 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.73■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 NTSR2O95665 410 aa25.73■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 PARP10Q53GL7 1025 aa25.73■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.73■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 CCER2I3L3R5 266 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 TCIRG1Q13488 830 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 ERFEQ4G0M1 354 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 MASTLQ96GX5 879 aa25.72■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 CACNA1SQ13698 1873 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 SLX4Q8IY92 1834 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 CNKSR1Q969H4 720 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 SBF1O95248 1867 aa25.7■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 NPR1P16066 1061 aa25.69■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 NLRP10Q86W26 655 aa25.69■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF521Q96K83 1311 aa25.68■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 CRY2Q49AN0 593 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms