RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499392.1

LRAT-202, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRAT, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-202ENST00000499392 AIDAQ96BJ3 306 aa7.59□□□□□ -1.19
LRAT-202ENST00000499392 GPAMQ9HCL2 828 aa7.59□□□□□ -1.19
LRAT-202ENST00000499392 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.59□□□□□ -1.19
LRAT-202ENST00000499392 TOPBP1Q92547 1522 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 H7C1W4 665 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 KLRG1Q96E93 195 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ZIC5Q96T25 663 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 RUBCNLQ9H714 662 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 FOXO3O43524 673 aa7.57□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 PRMT3O60678 531 aa7.57□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 SV2AQ7L0J3 742 aa7.57□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.57□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ARHGEF11O15085 1522 aa7.56□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 A0A1W2PNR3 127 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 CDC14CA4D256 554 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 CARNS1A5YM72 827 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 GMPRP36959 345 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 NLRP8Q86W28 1048 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 PGBD3Q8N328 593 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 USTQ9Y2C2 406 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 IFT140Q96RY7 1462 aa7.55□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 WIPF1O43516 503 aa7.54□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 KRT76Q01546 638 aa7.54□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 GAS6Q14393 721 aa7.54□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 COL26A1Q96A83 441 aa7.54□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 HCN2Q9UL51 889 aa7.54□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 SSFA2P28290 1259 aa7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 EFHC2Q5JST6 749 aa7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 RETREG2Q8NC44 543 aa7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LRAT-202ENST00000499392 ATP2B4P23634 1241 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 RTN1Q16799 776 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 MYO19Q96H55 970 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 WDR97A6NE52 1622 aa7.52□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 GPR25O00155 361 aa7.51□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 BNIP3LO60238 219 aa7.51□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.51□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.51□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.51□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.51□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 NGLY1Q96IV0 654 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 SUSD3Q96L08 255 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 BCS1LQ9Y276 419 aa7.5□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 ARAP1Q96P48 1450 aa7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 EFSO43281 561 aa7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 FAM157BP0CG42 384 aa7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 TNP2Q05952 138 aa7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 COX20Q5RI15 118 aa7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 SCNN1AP37088 669 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 149.1
LRAT-202ENST00000499392 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 IER5Q5VY09 327 aa7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 KLK14Q9P0G3 267 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms