RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Six6os1Q9CTN5 574 aa16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ebag9Q9D0V7 213 aa16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 U2af2P26369 475 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tex35Q14BK3 207 aa16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PsapQ61207 557 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Snx13Q6PHS6 957 aa16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Naa25Q8BWZ3 972 aa16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa16.03■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Limch1Q3UH68 1057 aa16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eif3j2Q66JS6 263 aa16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 KdrP35918 1367 aa16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm156Q58A37 223 aa16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fsd2Q8BZ52 692 aa16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fbxo3Q9DC63 480 aa16.02■□□□□ 0.16
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt84Q99M73 603 aa16.02■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Diaph1O08808 1255 aa16.02■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf653Q6YND2 615 aa16.02■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 HypkQ9CR41 129 aa16.01■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cetn2Q9R1K9 172 aa16.01■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc148Q6P5U8 527 aa16.01■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Syt10Q9R0N4 523 aa16.01■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pnpla2Q8BJ56 486 aa16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Anp32cQ64G17 123 aa16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc42Q5SV66 316 aa16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AlkP97793 1621 aa16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Opa1P58281 960 aa16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa16■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnip1Q9WUU8 647 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cplx4Q80WM3 160 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cul7Q8VE73 1689 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zkscan4Q5SZT6 480 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ZfxP17012 799 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TbcaP48428 108 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf131Q8K3J5 619 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abcc6Q9R1S7 1498 aa15.99■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trak2Q6P9N8 913 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdk19Q8BWD8 501 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Themis2Q91YX0 663 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hdhd2Q3UGR5 259 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rab3il1Q8VDV3 383 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Top1Q04750 767 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ehmt1Q5DW34 1296 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam177a1Q8BR63 207 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp1a4Q9WV27 1032 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm28510A0A087WP28 240 aa15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Srgap1Q91Z69 1062 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sbno1Q689Z5 1390 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gramd4Q8CB44 633 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sel1lQ9Z2G6 790 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hecw1Q8K4P8 1604 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Brf1Q8CFK2 676 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sept14Q9DA97 430 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf704Q9ERQ3 566 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gbp8Q2V6D6 525 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plch2A2AP18 1501 aa15.97■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnf17Q99MV7 1640 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tyro3P55144 880 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm44503E9PYU5 387 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Syt1P46096 421 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Neurl4Q5NCX5 1563 aa15.96■□□□□ 0.15
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gli2Q0VGT2 1544 aa15.96■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 LyarQ08288 388 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prl7d1P04769 244 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stmn4P63042 189 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 EsrrbQ61539 433 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 InsrP15208 1372 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AnkarA2RT91 1465 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Oas2E9Q9A9 742 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bloc1s4Q8VED2 215 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SncbQ91ZZ3 133 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tubb2aQ7TMM9 445 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tubb2bQ9CWF2 445 aa15.95■□□□□ 0.14
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.4 ms