Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM3

Cplx4, Complexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx4Q80WM3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cplx4Q80WM3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cplx4Q80WM3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cplx4Q80WM3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cplx4Q80WM3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Cplx4Q80WM3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,05■■■□□ 2,88
Cplx4Q80WM3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Cplx4Q80WM3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Cplx4Q80WM3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Cplx4Q80WM3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Cplx4Q80WM3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Cplx4Q80WM3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cplx4Q80WM3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cplx4Q80WM3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Cplx4Q80WM3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Cplx4Q80WM3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Cplx4Q80WM3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cplx4Q80WM3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cplx4Q80WM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Cplx4Q80WM3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Cplx4Q80WM3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Cplx4Q80WM3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cplx4Q80WM3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Cplx4Q80WM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Cplx4Q80WM3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Cplx4Q80WM3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Cplx4Q80WM3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Cplx4Q80WM3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Cplx4Q80WM3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cplx4Q80WM3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cplx4Q80WM3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cplx4Q80WM3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cplx4Q80WM3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cplx4Q80WM3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cplx4Q80WM3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cplx4Q80WM3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Cplx4Q80WM3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cplx4Q80WM3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cplx4Q80WM3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cplx4Q80WM3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cplx4Q80WM3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cplx4Q80WM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Cplx4Q80WM3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cplx4Q80WM3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cplx4Q80WM3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cplx4Q80WM3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cplx4Q80WM3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Cplx4Q80WM3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Cplx4Q80WM3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cplx4Q80WM3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cplx4Q80WM3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cplx4Q80WM3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cplx4Q80WM3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cplx4Q80WM3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cplx4Q80WM3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cplx4Q80WM3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cplx4Q80WM3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cplx4Q80WM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cplx4Q80WM3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Cplx4Q80WM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Cplx4Q80WM3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cplx4Q80WM3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cplx4Q80WM3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cplx4Q80WM3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cplx4Q80WM3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cplx4Q80WM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx4Q80WM3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cplx4Q80WM3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx4Q80WM3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx4Q80WM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx4Q80WM3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cplx4Q80WM3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cplx4Q80WM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cplx4Q80WM3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cplx4Q80WM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Cplx4Q80WM3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Cplx4Q80WM3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cplx4Q80WM3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cplx4Q80WM3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cplx4Q80WM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cplx4Q80WM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cplx4Q80WM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cplx4Q80WM3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cplx4Q80WM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cplx4Q80WM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cplx4Q80WM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Cplx4Q80WM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Cplx4Q80WM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms