Protein–RNA interactions for Protein: P63042

Stmn4, Stathmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn4P63042 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Stmn4P63042 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Stmn4P63042 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Stmn4P63042 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Stmn4P63042 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Stmn4P63042 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Stmn4P63042 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Stmn4P63042 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Stmn4P63042 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Stmn4P63042 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Stmn4P63042 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Stmn4P63042 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Stmn4P63042 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Stmn4P63042 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Stmn4P63042 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Stmn4P63042 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Stmn4P63042 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Stmn4P63042 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Stmn4P63042 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,2■■■□□ 2,58
Stmn4P63042 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Stmn4P63042 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Stmn4P63042 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Stmn4P63042 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Stmn4P63042 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Stmn4P63042 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Stmn4P63042 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Stmn4P63042 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Stmn4P63042 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Stmn4P63042 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Stmn4P63042 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Stmn4P63042 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Stmn4P63042 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Stmn4P63042 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Stmn4P63042 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Stmn4P63042 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Stmn4P63042 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Stmn4P63042 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Stmn4P63042 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Stmn4P63042 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Stmn4P63042 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Stmn4P63042 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Stmn4P63042 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Stmn4P63042 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stmn4P63042 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Stmn4P63042 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stmn4P63042 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stmn4P63042 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stmn4P63042 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Stmn4P63042 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Stmn4P63042 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Stmn4P63042 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Stmn4P63042 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Stmn4P63042 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Stmn4P63042 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Stmn4P63042 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Stmn4P63042 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stmn4P63042 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Stmn4P63042 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stmn4P63042 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stmn4P63042 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Stmn4P63042 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Stmn4P63042 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Stmn4P63042 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Stmn4P63042 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stmn4P63042 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stmn4P63042 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stmn4P63042 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Stmn4P63042 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Stmn4P63042 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Stmn4P63042 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Stmn4P63042 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Stmn4P63042 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stmn4P63042 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Stmn4P63042 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Stmn4P63042 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Stmn4P63042 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Stmn4P63042 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Stmn4P63042 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Stmn4P63042 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Stmn4P63042 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Stmn4P63042 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Stmn4P63042 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Stmn4P63042 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Stmn4P63042 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Stmn4P63042 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Stmn4P63042 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Stmn4P63042 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Stmn4P63042 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Stmn4P63042 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Stmn4P63042 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Stmn4P63042 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Stmn4P63042 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Stmn4P63042 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Stmn4P63042 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Stmn4P63042 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Stmn4P63042 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Stmn4P63042 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Stmn4P63042 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Stmn4P63042 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Stmn4P63042 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,6 ms