RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Skida1Q80YR3 822 aa28.96■■■□□ 2.23
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pcdhb16Q91Y03 802 aa28.96■■■□□ 2.23
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tnk1Q99ML2 666 aa28.96■■■□□ 2.23
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tmbim4Q9DA39 238 aa28.96■■■□□ 2.23
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pycr3Q9DCC4 274 aa28.96■■■□□ 2.23
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Prl3c1Q9QUN5 212 aa28.96■■■□□ 2.23
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Vmn1r175K7N6T9 304 aa28.95■■■□□ 2.22
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arhgap39P59281 1107 aa28.95■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Slc35d3Q8BGF8 422 aa28.95■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Psd2Q6P1I6 770 aa28.94■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Slc19a3Q99PL8 488 aa28.94■■■□□ 2.22
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Prl7c1Q9CRB5 251 aa28.94■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ctsll3Q3ULP7 331 aa28.93■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cdk15Q3V3A1 433 aa28.92■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ehd3Q9QXY6 535 aa28.91■■■□□ 2.22
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cd300ld2A2A7W0 305 aa28.91■■■□□ 2.22
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 CebpbP28033 296 aa28.91■■■□□ 2.22
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