Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB5

Prl7c1, Prolactin-7C1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl7c1Q9CRB5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Prl7c1Q9CRB5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Prl7c1Q9CRB5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Prl7c1Q9CRB5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Prl7c1Q9CRB5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Prl7c1Q9CRB5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Prl7c1Q9CRB5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Prl7c1Q9CRB5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Prl7c1Q9CRB5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Prl7c1Q9CRB5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Prl7c1Q9CRB5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Prl7c1Q9CRB5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Prl7c1Q9CRB5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Prl7c1Q9CRB5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Prl7c1Q9CRB5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Prl7c1Q9CRB5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Prl7c1Q9CRB5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Prl7c1Q9CRB5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Prl7c1Q9CRB5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prl7c1Q9CRB5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Prl7c1Q9CRB5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Prl7c1Q9CRB5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Prl7c1Q9CRB5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Prl7c1Q9CRB5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Prl7c1Q9CRB5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Prl7c1Q9CRB5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Prl7c1Q9CRB5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Prl7c1Q9CRB5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Prl7c1Q9CRB5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Prl7c1Q9CRB5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Prl7c1Q9CRB5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Prl7c1Q9CRB5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Prl7c1Q9CRB5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Prl7c1Q9CRB5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Prl7c1Q9CRB5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Prl7c1Q9CRB5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Prl7c1Q9CRB5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Prl7c1Q9CRB5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Prl7c1Q9CRB5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Prl7c1Q9CRB5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Prl7c1Q9CRB5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Prl7c1Q9CRB5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Prl7c1Q9CRB5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Prl7c1Q9CRB5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Prl7c1Q9CRB5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Prl7c1Q9CRB5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Prl7c1Q9CRB5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Prl7c1Q9CRB5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Prl7c1Q9CRB5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Prl7c1Q9CRB5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Prl7c1Q9CRB5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Prl7c1Q9CRB5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Prl7c1Q9CRB5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Prl7c1Q9CRB5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Prl7c1Q9CRB5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,45■■□□□ 1,99
Prl7c1Q9CRB5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Prl7c1Q9CRB5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Prl7c1Q9CRB5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Prl7c1Q9CRB5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Prl7c1Q9CRB5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Prl7c1Q9CRB5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Prl7c1Q9CRB5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Prl7c1Q9CRB5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Prl7c1Q9CRB5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Prl7c1Q9CRB5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Prl7c1Q9CRB5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Prl7c1Q9CRB5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Prl7c1Q9CRB5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Prl7c1Q9CRB5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Prl7c1Q9CRB5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Prl7c1Q9CRB5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Prl7c1Q9CRB5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Prl7c1Q9CRB5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Prl7c1Q9CRB5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Prl7c1Q9CRB5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Prl7c1Q9CRB5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Prl7c1Q9CRB5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Prl7c1Q9CRB5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Prl7c1Q9CRB5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Prl7c1Q9CRB5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Prl7c1Q9CRB5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Prl7c1Q9CRB5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Prl7c1Q9CRB5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Prl7c1Q9CRB5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Prl7c1Q9CRB5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Prl7c1Q9CRB5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Prl7c1Q9CRB5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Prl7c1Q9CRB5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Prl7c1Q9CRB5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Prl7c1Q9CRB5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Prl7c1Q9CRB5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Prl7c1Q9CRB5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Prl7c1Q9CRB5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Prl7c1Q9CRB5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Prl7c1Q9CRB5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Prl7c1Q9CRB5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Prl7c1Q9CRB5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Prl7c1Q9CRB5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Prl7c1Q9CRB5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Prl7c1Q9CRB5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,4 ms