RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Abcc8B2RUS7 1588 aa65.17■■■■■ 8.02
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kdm5dQ62240 1548 aa60.51■■■■■ 7.28
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa59.02■■■■■ 7.04
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa54.91■■■■■ 6.38
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fam135aQ6NS59 1506 aa54.69■■■■■ 6.35
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Unc13aQ4KUS2 1712 aa54.21■■■■■ 6.27
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ubl4bQ9CQ84 188 aa53.96■■■■■ 6.23
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mrc2Q64449 1479 aa53.42■■■■■ 6.14
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kif15Q6P9L6 1387 aa53.27■■■■■ 6.12
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Top2bQ64511 1612 aa53.25■■■■■ 6.12
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Lamc3Q9R0B6 1581 aa53.22■■■■■ 6.11
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cngb1E1AZ71 1325 aa53.21■■■■■ 6.11
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cux2P70298 1426 aa53.06■■■■■ 6.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 TnnQ80Z71 1560 aa52.86■■■■■ 6.05
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fmn1Q05860 1466 aa52.67■■■■■ 6.02
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Grin2bQ01097 1482 aa51.71■■■■■ 5.87
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP51.69■■■■■ 5.86
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Plb1Q3TTY0 1478 aa51.66■■■■■ 5.86
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 HrcG5E8J6 738 aa51.66■■■■■ 5.86
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Duox2A2AQ99 1517 aa51.57■■■■■ 5.85
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP51.47■■■■■ 5.83
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 NrkQ9R0G8 1455 aa51.35■■■■■ 5.81
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Efcab5A0JP43 1406 aa51.34■■■■■ 5.81
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ift140E9PY46 1464 aa51.26■■■■■ 5.8
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Samd9lQ69Z37 1561 aa51.17■■■■■ 5.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rusc2Q80U22 1514 aa50.9■■■■■ 5.74
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 SynmQ70IV5 1561 aa50.65■■■■■ 5.7
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Grin2aP35436 1464 aa50.64■■■■■ 5.7
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Zeb1Q64318 1117 aa50.58■■■■■ 5.69
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa50.56■■■■■ 5.68
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa50.5■■■■■ 5.67
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pla2r1Q62028 1487 aa50.47■■■■■ 5.67
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gpatch8A2A6A1 1505 aa50.38■■■■■ 5.66
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Shroom2A2ALU4 1481 aa50.37■■■■■ 5.65
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP50.36■■■■■ 5.65
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arhgap35Q91YM2 1499 aa50.31■■■■■ 5.64
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cep162Q6ZQ06 1403 aa50.23■■■■■ 5.63
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Map3k1P53349 1493 aa50.23■■■■■ 5.63
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
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