Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB0

Klf7, Krueppel-like factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf7Q99JB0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Klf7Q99JB0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Klf7Q99JB0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Klf7Q99JB0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Klf7Q99JB0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Klf7Q99JB0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Klf7Q99JB0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Klf7Q99JB0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Klf7Q99JB0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Klf7Q99JB0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klf7Q99JB0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Klf7Q99JB0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Klf7Q99JB0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Klf7Q99JB0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Klf7Q99JB0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klf7Q99JB0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klf7Q99JB0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Klf7Q99JB0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Klf7Q99JB0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klf7Q99JB0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klf7Q99JB0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klf7Q99JB0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Klf7Q99JB0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Klf7Q99JB0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Klf7Q99JB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Klf7Q99JB0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Klf7Q99JB0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Klf7Q99JB0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klf7Q99JB0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Klf7Q99JB0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klf7Q99JB0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Klf7Q99JB0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Klf7Q99JB0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Klf7Q99JB0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Klf7Q99JB0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Klf7Q99JB0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klf7Q99JB0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klf7Q99JB0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Klf7Q99JB0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klf7Q99JB0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klf7Q99JB0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Klf7Q99JB0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klf7Q99JB0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klf7Q99JB0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klf7Q99JB0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Klf7Q99JB0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Klf7Q99JB0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klf7Q99JB0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klf7Q99JB0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klf7Q99JB0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klf7Q99JB0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klf7Q99JB0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klf7Q99JB0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klf7Q99JB0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klf7Q99JB0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Klf7Q99JB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klf7Q99JB0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klf7Q99JB0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klf7Q99JB0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klf7Q99JB0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Klf7Q99JB0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klf7Q99JB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klf7Q99JB0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klf7Q99JB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klf7Q99JB0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klf7Q99JB0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klf7Q99JB0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klf7Q99JB0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Klf7Q99JB0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klf7Q99JB0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Klf7Q99JB0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klf7Q99JB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klf7Q99JB0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klf7Q99JB0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klf7Q99JB0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klf7Q99JB0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klf7Q99JB0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Klf7Q99JB0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klf7Q99JB0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klf7Q99JB0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Klf7Q99JB0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klf7Q99JB0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klf7Q99JB0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klf7Q99JB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Klf7Q99JB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Klf7Q99JB0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Klf7Q99JB0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klf7Q99JB0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klf7Q99JB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Klf7Q99JB0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klf7Q99JB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klf7Q99JB0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klf7Q99JB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klf7Q99JB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klf7Q99JB0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klf7Q99JB0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Klf7Q99JB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klf7Q99JB0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klf7Q99JB0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klf7Q99JB0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms