Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Thoc6Q5U4D9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Thoc6Q5U4D9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Thoc6Q5U4D9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Thoc6Q5U4D9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Thoc6Q5U4D9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Thoc6Q5U4D9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Thoc6Q5U4D9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Thoc6Q5U4D9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Thoc6Q5U4D9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Thoc6Q5U4D9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Thoc6Q5U4D9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Thoc6Q5U4D9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Thoc6Q5U4D9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Thoc6Q5U4D9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Thoc6Q5U4D9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Thoc6Q5U4D9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Thoc6Q5U4D9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Thoc6Q5U4D9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Thoc6Q5U4D9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Thoc6Q5U4D9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thoc6Q5U4D9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Thoc6Q5U4D9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Thoc6Q5U4D9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thoc6Q5U4D9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thoc6Q5U4D9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thoc6Q5U4D9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thoc6Q5U4D9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Thoc6Q5U4D9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Thoc6Q5U4D9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Thoc6Q5U4D9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Thoc6Q5U4D9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Thoc6Q5U4D9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thoc6Q5U4D9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thoc6Q5U4D9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thoc6Q5U4D9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thoc6Q5U4D9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thoc6Q5U4D9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thoc6Q5U4D9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Thoc6Q5U4D9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Thoc6Q5U4D9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Thoc6Q5U4D9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Thoc6Q5U4D9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Thoc6Q5U4D9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Thoc6Q5U4D9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Thoc6Q5U4D9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Thoc6Q5U4D9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Thoc6Q5U4D9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Thoc6Q5U4D9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thoc6Q5U4D9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Thoc6Q5U4D9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thoc6Q5U4D9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thoc6Q5U4D9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thoc6Q5U4D9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thoc6Q5U4D9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Thoc6Q5U4D9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thoc6Q5U4D9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thoc6Q5U4D9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Thoc6Q5U4D9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Thoc6Q5U4D9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Thoc6Q5U4D9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thoc6Q5U4D9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thoc6Q5U4D9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Thoc6Q5U4D9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Thoc6Q5U4D9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Thoc6Q5U4D9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Thoc6Q5U4D9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thoc6Q5U4D9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thoc6Q5U4D9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thoc6Q5U4D9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Thoc6Q5U4D9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thoc6Q5U4D9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thoc6Q5U4D9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Thoc6Q5U4D9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Thoc6Q5U4D9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Thoc6Q5U4D9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thoc6Q5U4D9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Thoc6Q5U4D9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Thoc6Q5U4D9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Thoc6Q5U4D9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thoc6Q5U4D9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thoc6Q5U4D9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Thoc6Q5U4D9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Thoc6Q5U4D9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Thoc6Q5U4D9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Thoc6Q5U4D9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Thoc6Q5U4D9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Thoc6Q5U4D9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Thoc6Q5U4D9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thoc6Q5U4D9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thoc6Q5U4D9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thoc6Q5U4D9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Thoc6Q5U4D9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Thoc6Q5U4D9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Thoc6Q5U4D9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Thoc6Q5U4D9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Thoc6Q5U4D9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Thoc6Q5U4D9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thoc6Q5U4D9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thoc6Q5U4D9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms