Protein–RNA interactions for Protein: P59281

Arhgap39, Rho GTPase-activating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap39P59281 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Arhgap39P59281 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Arhgap39P59281 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Arhgap39P59281 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Arhgap39P59281 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Arhgap39P59281 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Arhgap39P59281 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Arhgap39P59281 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Arhgap39P59281 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Arhgap39P59281 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Arhgap39P59281 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Arhgap39P59281 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Arhgap39P59281 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Arhgap39P59281 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Arhgap39P59281 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
Arhgap39P59281 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Arhgap39P59281 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Arhgap39P59281 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Arhgap39P59281 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Arhgap39P59281 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Arhgap39P59281 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Arhgap39P59281 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Arhgap39P59281 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Arhgap39P59281 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Arhgap39P59281 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Arhgap39P59281 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Arhgap39P59281 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Arhgap39P59281 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Arhgap39P59281 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Arhgap39P59281 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Arhgap39P59281 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Arhgap39P59281 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Arhgap39P59281 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Arhgap39P59281 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Arhgap39P59281 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Arhgap39P59281 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Arhgap39P59281 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Arhgap39P59281 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Arhgap39P59281 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Arhgap39P59281 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Arhgap39P59281 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Arhgap39P59281 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Arhgap39P59281 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Arhgap39P59281 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Arhgap39P59281 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Arhgap39P59281 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Arhgap39P59281 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Arhgap39P59281 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Arhgap39P59281 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Arhgap39P59281 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Arhgap39P59281 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Arhgap39P59281 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Arhgap39P59281 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Arhgap39P59281 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Arhgap39P59281 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Arhgap39P59281 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Arhgap39P59281 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Arhgap39P59281 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Arhgap39P59281 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Arhgap39P59281 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Arhgap39P59281 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Arhgap39P59281 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Arhgap39P59281 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Arhgap39P59281 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Arhgap39P59281 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Arhgap39P59281 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Arhgap39P59281 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Arhgap39P59281 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Arhgap39P59281 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Arhgap39P59281 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Arhgap39P59281 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Arhgap39P59281 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Arhgap39P59281 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Arhgap39P59281 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Arhgap39P59281 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Arhgap39P59281 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Arhgap39P59281 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Arhgap39P59281 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Arhgap39P59281 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Arhgap39P59281 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Arhgap39P59281 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Arhgap39P59281 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Arhgap39P59281 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Arhgap39P59281 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Arhgap39P59281 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Arhgap39P59281 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Arhgap39P59281 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Arhgap39P59281 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Arhgap39P59281 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Arhgap39P59281 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Arhgap39P59281 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Arhgap39P59281 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Arhgap39P59281 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Arhgap39P59281 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Arhgap39P59281 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Arhgap39P59281 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Arhgap39P59281 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Arhgap39P59281 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Arhgap39P59281 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Arhgap39P59281 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms