RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ak5Q920P5 562 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hemk1Q921L7 340 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chid1Q922Q9 393 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cby3Q9CVN6 235 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dsn1Q9CYC5 348 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Efcab1Q9D3N2 212 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nacc2Q9DCM7 586 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aqp5Q9WTY4 265 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amd2D3Z6H8 334 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amd1P0DMN7 334 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa-rs2P17534 91 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdx2P43241 311 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrpap1P55302 360 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap39P59281 1107 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Csn1s2aQ02862 184 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp25Q3U435 615 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pak6Q3ULB5 682 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd37Q569N2 159 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Otub1Q7TQI3 271 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsfy2Q80Y37 392 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crls1Q80ZM8 303 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt7Q99P30 236 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tomm70Q9CZW5 611 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnase1l2Q9D1G0 278 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ca5bQ9QZA0 317 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 5430401F13RikE9Q328 175 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 A530032D15RikE9Q422 215 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8011K7N6Y5 207 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc16a8O35308 492 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 IghmP01872 454 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 HexaP29416 528 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab8aP55258 207 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 S100a5P63084 93 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 NfycP70353 335 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 NptnP97300 397 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 PigwQ8C398 503 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps50Q8CI71 964 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erich5Q8K0S2 362 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem159Q922Z1 161 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nde1Q9CZA6 344 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc34Q9DAM1 415 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Htr3bQ9JHJ5 437 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acot2Q9QYR9 453 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhox2dW4VSN9 191 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7945F6QI24 236 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r92L7N2A4 860 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cct8P42932 548 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr5a2P45448 560 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9a3r1P70441 355 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep76Q0VEJ0 659 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a40Q8BGP6 337 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr157Q8C206 330 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mgat2Q921V5 442 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex22Q9D9U4 189 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Natd1Q9DBW3 110 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Paqr5Q9DCU0 330 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cldn6Q9Z262 219 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas2r122D3YU55 309 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp619G3X9T2 1161 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21976J3QNN2 249 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs7O54829 469 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klk1b8P07628 261 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 PahP16331 453 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 ArsaP50428 506 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 HccsP53702 272 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim31Q8R0K2 507 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr700Q8VFM5 316 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smap1Q91VZ6 440 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc77Q9CZH8 489 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hs6st1Q9QYK5 411 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm595A2AF73 655 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xlr5aA2BI45 236 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2j5O54749 501 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dok2O70469 412 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 MdkP12025 140 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rb1P13405 921 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 RxrgP28705 463 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsta3P30115 221 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 TtlP38585 377 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pex2P55098 305 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 TepsinQ3U3N6 573 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syndig1lQ3USQ7 237 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 C1orf109Q499E6 217 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kirrel2Q7TSU7 700 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lair1Q8BG84 263 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1033Q8VFK5 310 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr522Q8VGL1 312 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.4 ms