Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Cldn6Q9Z262 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Cldn6Q9Z262 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Cldn6Q9Z262 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Cldn6Q9Z262 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Cldn6Q9Z262 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Cldn6Q9Z262 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Cldn6Q9Z262 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cldn6Q9Z262 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Cldn6Q9Z262 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Cldn6Q9Z262 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Cldn6Q9Z262 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Cldn6Q9Z262 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Cldn6Q9Z262 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cldn6Q9Z262 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cldn6Q9Z262 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cldn6Q9Z262 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cldn6Q9Z262 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cldn6Q9Z262 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cldn6Q9Z262 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cldn6Q9Z262 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cldn6Q9Z262 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cldn6Q9Z262 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Cldn6Q9Z262 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cldn6Q9Z262 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cldn6Q9Z262 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Cldn6Q9Z262 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cldn6Q9Z262 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Cldn6Q9Z262 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cldn6Q9Z262 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cldn6Q9Z262 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cldn6Q9Z262 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cldn6Q9Z262 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cldn6Q9Z262 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cldn6Q9Z262 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cldn6Q9Z262 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cldn6Q9Z262 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cldn6Q9Z262 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Cldn6Q9Z262 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cldn6Q9Z262 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cldn6Q9Z262 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cldn6Q9Z262 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cldn6Q9Z262 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Cldn6Q9Z262 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Cldn6Q9Z262 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Cldn6Q9Z262 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cldn6Q9Z262 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cldn6Q9Z262 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Cldn6Q9Z262 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cldn6Q9Z262 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cldn6Q9Z262 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cldn6Q9Z262 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cldn6Q9Z262 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cldn6Q9Z262 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cldn6Q9Z262 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cldn6Q9Z262 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Cldn6Q9Z262 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cldn6Q9Z262 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cldn6Q9Z262 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cldn6Q9Z262 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Cldn6Q9Z262 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cldn6Q9Z262 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Cldn6Q9Z262 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cldn6Q9Z262 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cldn6Q9Z262 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cldn6Q9Z262 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cldn6Q9Z262 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Cldn6Q9Z262 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Cldn6Q9Z262 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Cldn6Q9Z262 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cldn6Q9Z262 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cldn6Q9Z262 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Cldn6Q9Z262 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cldn6Q9Z262 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cldn6Q9Z262 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cldn6Q9Z262 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Cldn6Q9Z262 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Cldn6Q9Z262 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Cldn6Q9Z262 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cldn6Q9Z262 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cldn6Q9Z262 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Cldn6Q9Z262 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Cldn6Q9Z262 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cldn6Q9Z262 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Cldn6Q9Z262 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cldn6Q9Z262 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Cldn6Q9Z262 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cldn6Q9Z262 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Cldn6Q9Z262 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Cldn6Q9Z262 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cldn6Q9Z262 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cldn6Q9Z262 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Cldn6Q9Z262 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cldn6Q9Z262 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Cldn6Q9Z262 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Cldn6Q9Z262 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Cldn6Q9Z262 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Cldn6Q9Z262 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Cldn6Q9Z262 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Cldn6Q9Z262 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,2 ms