Protein–RNA interactions for Protein: Q02862

Csn1s2a, Alpha-S2-casein-like A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s2aQ02862 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Csn1s2aQ02862 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Csn1s2aQ02862 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Csn1s2aQ02862 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Csn1s2aQ02862 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Csn1s2aQ02862 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Csn1s2aQ02862 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csn1s2aQ02862 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Csn1s2aQ02862 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Csn1s2aQ02862 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Csn1s2aQ02862 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Csn1s2aQ02862 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Csn1s2aQ02862 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csn1s2aQ02862 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Csn1s2aQ02862 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Csn1s2aQ02862 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Csn1s2aQ02862 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csn1s2aQ02862 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csn1s2aQ02862 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csn1s2aQ02862 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csn1s2aQ02862 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Csn1s2aQ02862 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Csn1s2aQ02862 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csn1s2aQ02862 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csn1s2aQ02862 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csn1s2aQ02862 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Csn1s2aQ02862 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Csn1s2aQ02862 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Csn1s2aQ02862 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Csn1s2aQ02862 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Csn1s2aQ02862 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csn1s2aQ02862 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Csn1s2aQ02862 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csn1s2aQ02862 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csn1s2aQ02862 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Csn1s2aQ02862 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csn1s2aQ02862 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csn1s2aQ02862 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csn1s2aQ02862 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csn1s2aQ02862 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Csn1s2aQ02862 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Csn1s2aQ02862 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Csn1s2aQ02862 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Csn1s2aQ02862 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csn1s2aQ02862 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Csn1s2aQ02862 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csn1s2aQ02862 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Csn1s2aQ02862 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Csn1s2aQ02862 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Csn1s2aQ02862 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Csn1s2aQ02862 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Csn1s2aQ02862 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csn1s2aQ02862 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Csn1s2aQ02862 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csn1s2aQ02862 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csn1s2aQ02862 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Csn1s2aQ02862 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csn1s2aQ02862 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Csn1s2aQ02862 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Csn1s2aQ02862 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Csn1s2aQ02862 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Csn1s2aQ02862 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csn1s2aQ02862 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csn1s2aQ02862 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csn1s2aQ02862 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csn1s2aQ02862 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Csn1s2aQ02862 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Csn1s2aQ02862 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csn1s2aQ02862 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Csn1s2aQ02862 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Csn1s2aQ02862 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Csn1s2aQ02862 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csn1s2aQ02862 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csn1s2aQ02862 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csn1s2aQ02862 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Csn1s2aQ02862 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Csn1s2aQ02862 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Csn1s2aQ02862 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csn1s2aQ02862 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csn1s2aQ02862 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csn1s2aQ02862 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Csn1s2aQ02862 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csn1s2aQ02862 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csn1s2aQ02862 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csn1s2aQ02862 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csn1s2aQ02862 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csn1s2aQ02862 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csn1s2aQ02862 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csn1s2aQ02862 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csn1s2aQ02862 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csn1s2aQ02862 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csn1s2aQ02862 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csn1s2aQ02862 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms