Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Rab8aP55258 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Rab8aP55258 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rab8aP55258 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rab8aP55258 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Rab8aP55258 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Rab8aP55258 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Rab8aP55258 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rab8aP55258 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rab8aP55258 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rab8aP55258 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rab8aP55258 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rab8aP55258 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rab8aP55258 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Rab8aP55258 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Rab8aP55258 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Rab8aP55258 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Rab8aP55258 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rab8aP55258 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rab8aP55258 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rab8aP55258 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Rab8aP55258 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rab8aP55258 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rab8aP55258 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rab8aP55258 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rab8aP55258 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Rab8aP55258 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Rab8aP55258 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Rab8aP55258 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rab8aP55258 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab8aP55258 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab8aP55258 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rab8aP55258 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Rab8aP55258 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Rab8aP55258 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Rab8aP55258 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rab8aP55258 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rab8aP55258 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rab8aP55258 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Rab8aP55258 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rab8aP55258 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Rab8aP55258 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Rab8aP55258 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Rab8aP55258 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rab8aP55258 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rab8aP55258 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rab8aP55258 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Rab8aP55258 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rab8aP55258 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Rab8aP55258 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rab8aP55258 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rab8aP55258 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rab8aP55258 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Rab8aP55258 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rab8aP55258 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rab8aP55258 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rab8aP55258 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rab8aP55258 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rab8aP55258 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rab8aP55258 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Rab8aP55258 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rab8aP55258 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Rab8aP55258 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rab8aP55258 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rab8aP55258 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rab8aP55258 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Rab8aP55258 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Rab8aP55258 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rab8aP55258 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rab8aP55258 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Rab8aP55258 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Rab8aP55258 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rab8aP55258 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rab8aP55258 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rab8aP55258 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab8aP55258 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab8aP55258 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rab8aP55258 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rab8aP55258 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rab8aP55258 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rab8aP55258 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rab8aP55258 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rab8aP55258 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rab8aP55258 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rab8aP55258 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rab8aP55258 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rab8aP55258 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rab8aP55258 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rab8aP55258 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rab8aP55258 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rab8aP55258 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Rab8aP55258 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rab8aP55258 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rab8aP55258 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rab8aP55258 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rab8aP55258 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rab8aP55258 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rab8aP55258 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rab8aP55258 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Rab8aP55258 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,9 ms