Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rab8aP55258 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Rab8aP55258 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rab8aP55258 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rab8aP55258 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Rab8aP55258 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rab8aP55258 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab8aP55258 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab8aP55258 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rab8aP55258 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab8aP55258 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab8aP55258 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab8aP55258 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab8aP55258 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab8aP55258 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab8aP55258 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab8aP55258 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rab8aP55258 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab8aP55258 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab8aP55258 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab8aP55258 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab8aP55258 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab8aP55258 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab8aP55258 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rab8aP55258 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab8aP55258 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rab8aP55258 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab8aP55258 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab8aP55258 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab8aP55258 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab8aP55258 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab8aP55258 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab8aP55258 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab8aP55258 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab8aP55258 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rab8aP55258 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab8aP55258 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab8aP55258 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab8aP55258 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab8aP55258 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab8aP55258 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab8aP55258 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rab8aP55258 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab8aP55258 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab8aP55258 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab8aP55258 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab8aP55258 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab8aP55258 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab8aP55258 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab8aP55258 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab8aP55258 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab8aP55258 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab8aP55258 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab8aP55258 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab8aP55258 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab8aP55258 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab8aP55258 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab8aP55258 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab8aP55258 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab8aP55258 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab8aP55258 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab8aP55258 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab8aP55258 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab8aP55258 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab8aP55258 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab8aP55258 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab8aP55258 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab8aP55258 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab8aP55258 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab8aP55258 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab8aP55258 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab8aP55258 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab8aP55258 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab8aP55258 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab8aP55258 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab8aP55258 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab8aP55258 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab8aP55258 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab8aP55258 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab8aP55258 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab8aP55258 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab8aP55258 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab8aP55258 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab8aP55258 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab8aP55258 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab8aP55258 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab8aP55258 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab8aP55258 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab8aP55258 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab8aP55258 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab8aP55258 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab8aP55258 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab8aP55258 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab8aP55258 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab8aP55258 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab8aP55258 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab8aP55258 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab8aP55258 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab8aP55258 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rab8aP55258 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms