Protein–RNA interactions for Protein: P45448

Nr5a2, Nuclear receptor subfamily 5 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr5a2P45448 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Nr5a2P45448 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nr5a2P45448 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nr5a2P45448 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nr5a2P45448 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nr5a2P45448 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nr5a2P45448 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Nr5a2P45448 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nr5a2P45448 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Nr5a2P45448 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nr5a2P45448 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nr5a2P45448 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nr5a2P45448 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Nr5a2P45448 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nr5a2P45448 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nr5a2P45448 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nr5a2P45448 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nr5a2P45448 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nr5a2P45448 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nr5a2P45448 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Nr5a2P45448 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nr5a2P45448 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nr5a2P45448 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nr5a2P45448 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nr5a2P45448 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nr5a2P45448 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nr5a2P45448 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nr5a2P45448 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nr5a2P45448 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nr5a2P45448 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nr5a2P45448 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nr5a2P45448 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nr5a2P45448 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nr5a2P45448 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr5a2P45448 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nr5a2P45448 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nr5a2P45448 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nr5a2P45448 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nr5a2P45448 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nr5a2P45448 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nr5a2P45448 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nr5a2P45448 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nr5a2P45448 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nr5a2P45448 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nr5a2P45448 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nr5a2P45448 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nr5a2P45448 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nr5a2P45448 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nr5a2P45448 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nr5a2P45448 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nr5a2P45448 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nr5a2P45448 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr5a2P45448 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr5a2P45448 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nr5a2P45448 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr5a2P45448 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr5a2P45448 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr5a2P45448 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr5a2P45448 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr5a2P45448 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr5a2P45448 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr5a2P45448 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr5a2P45448 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nr5a2P45448 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr5a2P45448 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nr5a2P45448 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr5a2P45448 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr5a2P45448 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr5a2P45448 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr5a2P45448 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr5a2P45448 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr5a2P45448 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr5a2P45448 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr5a2P45448 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nr5a2P45448 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nr5a2P45448 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr5a2P45448 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nr5a2P45448 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nr5a2P45448 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nr5a2P45448 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nr5a2P45448 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr5a2P45448 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nr5a2P45448 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nr5a2P45448 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nr5a2P45448 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nr5a2P45448 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nr5a2P45448 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nr5a2P45448 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nr5a2P45448 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nr5a2P45448 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nr5a2P45448 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nr5a2P45448 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr5a2P45448 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nr5a2P45448 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nr5a2P45448 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr5a2P45448 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr5a2P45448 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr5a2P45448 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr5a2P45448 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr5a2P45448 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms