RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409987.5

LSM5-206, Transcript of LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated, human

TSL 5 BASIC

Gene LSM5, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LSM5-206	ENST00000409987	PAX7	P23759	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	DPP4	P27487	766 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	OR1D2	P34982	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CETN2	P41208	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PRRX1	P54821	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	AIF1	P55008	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	HERV-K104	P63124	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PHEX	P78562	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PLD1	Q13393	1074 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987		R4GN57	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987		A0A0U1RQS6	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	MED7	O43513	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	BUB1	O43683	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CACNG3	O60359	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CLN5	O75503	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ECI2	O75521	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	BBOX1	O75936	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	OR4F21	O95013	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CA3	P07451	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PRSS1	P07477	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CD59	P13987	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	FCAR	P24071	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	SRD5A2	P31213	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	SLC6A8	P48029	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	HERV-K104	P61576	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CDR2	Q01850	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CDH18	Q13634	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RCN1	Q15293	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	EXT1	Q16394	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	AGK	Q53H12	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LSM5-206	ENST00000409987		E5RGE8	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms