RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LGALS12Q96DT0 336 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RBCK1Q9BYM8 510 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GXYLT2A0PJZ3 443 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ARGFXA6NJG6 315 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 F5H5P2 479 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LYPLA2O95372 231 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 S1PR1P21453 382 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PPP5CP53041 499 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DECR1Q16698 335 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SHFQ7M4L6 423 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TERB2Q8NHR7 220 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HHLA1C9JL84 531 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 NFATC1O95644 943 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SGCAQ16586 387 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 AARDQ4LEZ3 155 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GPRC6AQ5T6X5 926 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SUN3Q8TAQ9 357 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FKBP10Q96AY3 582 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CD300AQ9UGN4 299 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MYH10P35580 1976 aa10.61□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LILRB5O75023 590 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAJB5O75953 348 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 EVX2Q03828 476 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GPR149Q86SP6 731 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR56A3Q8NH54 315 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SDSLQ96GA7 329 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 H0YAE9 185 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CDK2P24941 298 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 NCS1P62166 190 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PMS2P3Q13401 168 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HES5Q5TA89 166 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HERVK_113Q902F9 699 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ARL5BQ96KC2 179 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR51B5Q9H339 312 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CACNA1FO60840 1977 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGEB1P43366 347 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HK3P52790 923 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TRAM2Q15035 370 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 BBS1Q8NFJ9 593 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SPPL2BQ8TCT7 592 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MYRFLQ96LU7 910 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC32Q9BV29 185 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ABCG5Q9H222 651 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CLEC3AO75596 197 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RFPL3O75679 317 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RETP07949 1114 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 BDKRB2P30411 391 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RORAP35398 523 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PIK3CBP42338 1070 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DPP6P42658 865 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ASPAP45381 313 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CDK3Q00526 305 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PPTC7Q8NI37 304 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SYNPO2LQ9H987 977 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 AHSGP02765 367 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MAOAP21397 527 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC2A5P22732 501 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNAB2Q13303 367 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CDC6Q99741 560 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CERS4Q9HA82 394 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 AMY2AP04746 511 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ARAFP10398 606 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CERS1P27544 350 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MEDAGQ5VYS4 303 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DESI1Q6ICB0 168 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SUSD1Q6UWL2 747 aa10.6□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms