RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FpgtG5E8F4 590 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pld3O35405 488 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01665 111 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01666 111 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pax7P47239 503 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Padi2Q08642 673 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfn2Q80U63 757 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf569Q80W31 679 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbbp8Q80YR6 893 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NapepldQ8BH82 396 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tigd4Q8BUZ3 513 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem125Q8CHQ6 216 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb35Q8R2I3 63 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g15Q8VEB4 412 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1263Q8VG63 306 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chchd6Q91VN4 273 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clcc1Q99LI2 539 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MINDY3Q9CV28 444 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hhipl2Q9D2G9 717 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upk3aQ9JKX8 287 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo8Q9QZN3 319 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ProdhQ9WU79 599 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10324L7N208 604 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acsm3Q3UNX5 580 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp868Q3UTQ6 422 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd42Q3V096 527 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nutm2Q3V0C3 733 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stox2Q499E5 926 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MagixQ4KL35 324 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr318Q5NCD7 306 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlgap3Q6PFD5 977 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd11Q8BG32 422 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec9aQ8BRU4 238 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13199Q8C8E0 125 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r81Q8R286 306 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr437Q8VEV1 310 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr447Q8VGP6 310 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col26a1Q91VF6 440 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfaip8Q921Z5 198 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmp1Q99KU0 406 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LipfQ9CPP7 395 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmed11Q9D2R4 215 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vnn3Q9QZ25 500 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scnn1gQ9WU39 655 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upk1bQ9Z2C6 260 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox2bA2A447 191 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1303A2AVW1 312 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox2cA2AWL9 191 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp738B8JJX8 793 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29394H3BIW7 199 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hnf4aP49698 474 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsc22d1P62500 1077 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2cbP62715 309 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2caP63330 309 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vat1Q62465 406 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r24Q8R2D6 296 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntmt1Q8R2U4 223 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scpep1Q920A5 452 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArhgdiaQ99PT1 204 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asf1aQ9CQE6 204 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timm50Q9D880 353 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xylt2Q9EPL0 865 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13088A2AGW6 460 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp964B2RR88 472 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r7E9PYL5 915 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r3H3BJ88 915 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r6H3BK29 913 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1513L7N457 313 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01675 107 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01676 107 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01677 107 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01678 107 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phxr1P15973 60 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk2P21661 637 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stat6P52633 837 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acod1P54987 488 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GcgP55095 180 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn1bP97952 218 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap5b1Q3TAP4 876 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olig3Q6PFG8 273 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1322Q7TQW3 310 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hus1Q8BQY8 280 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctdsp2Q8BX07 270 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SuoxQ8R086 546 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgre4Q91ZE5 689 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrebzfQ91ZR3 358 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EtfdhQ921G7 616 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcyt2Q922E4 404 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psat1Q99K85 370 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26657Q9CVR1 127 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28 ms