Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmed11Q9D2R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Tmed11Q9D2R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tmed11Q9D2R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmed11Q9D2R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmed11Q9D2R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmed11Q9D2R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmed11Q9D2R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmed11Q9D2R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmed11Q9D2R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmed11Q9D2R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmed11Q9D2R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmed11Q9D2R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmed11Q9D2R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmed11Q9D2R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmed11Q9D2R4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmed11Q9D2R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmed11Q9D2R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmed11Q9D2R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmed11Q9D2R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmed11Q9D2R4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed11Q9D2R4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed11Q9D2R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmed11Q9D2R4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmed11Q9D2R4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed11Q9D2R4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmed11Q9D2R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmed11Q9D2R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmed11Q9D2R4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed11Q9D2R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmed11Q9D2R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmed11Q9D2R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed11Q9D2R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmed11Q9D2R4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tmed11Q9D2R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmed11Q9D2R4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed11Q9D2R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed11Q9D2R4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed11Q9D2R4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmed11Q9D2R4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmed11Q9D2R4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmed11Q9D2R4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmed11Q9D2R4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmed11Q9D2R4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmed11Q9D2R4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmed11Q9D2R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmed11Q9D2R4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmed11Q9D2R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmed11Q9D2R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmed11Q9D2R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmed11Q9D2R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmed11Q9D2R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmed11Q9D2R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmed11Q9D2R4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmed11Q9D2R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmed11Q9D2R4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmed11Q9D2R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmed11Q9D2R4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmed11Q9D2R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmed11Q9D2R4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmed11Q9D2R4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmed11Q9D2R4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmed11Q9D2R4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed11Q9D2R4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed11Q9D2R4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed11Q9D2R4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed11Q9D2R4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed11Q9D2R4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed11Q9D2R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed11Q9D2R4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed11Q9D2R4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed11Q9D2R4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed11Q9D2R4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed11Q9D2R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed11Q9D2R4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmed11Q9D2R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed11Q9D2R4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed11Q9D2R4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed11Q9D2R4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed11Q9D2R4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed11Q9D2R4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed11Q9D2R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed11Q9D2R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmed11Q9D2R4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmed11Q9D2R4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed11Q9D2R4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmed11Q9D2R4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed11Q9D2R4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmed11Q9D2R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmed11Q9D2R4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmed11Q9D2R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmed11Q9D2R4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmed11Q9D2R4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmed11Q9D2R4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed11Q9D2R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmed11Q9D2R4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmed11Q9D2R4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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