Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Padi2Q08642 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Padi2Q08642 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Padi2Q08642 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Padi2Q08642 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Padi2Q08642 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Padi2Q08642 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Padi2Q08642 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Padi2Q08642 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Padi2Q08642 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Padi2Q08642 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Padi2Q08642 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Padi2Q08642 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Padi2Q08642 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Padi2Q08642 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Padi2Q08642 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Padi2Q08642 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Padi2Q08642 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Padi2Q08642 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Padi2Q08642 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Padi2Q08642 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Padi2Q08642 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Padi2Q08642 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Padi2Q08642 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Padi2Q08642 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Padi2Q08642 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Padi2Q08642 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Padi2Q08642 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Padi2Q08642 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Padi2Q08642 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Padi2Q08642 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Padi2Q08642 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Padi2Q08642 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Padi2Q08642 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Padi2Q08642 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Padi2Q08642 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Padi2Q08642 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Padi2Q08642 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Padi2Q08642 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Padi2Q08642 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Padi2Q08642 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Padi2Q08642 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Padi2Q08642 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Padi2Q08642 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Padi2Q08642 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Padi2Q08642 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Padi2Q08642 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Padi2Q08642 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Padi2Q08642 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Padi2Q08642 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Padi2Q08642 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Padi2Q08642 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Padi2Q08642 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Padi2Q08642 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Padi2Q08642 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Padi2Q08642 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Padi2Q08642 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Padi2Q08642 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Padi2Q08642 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Padi2Q08642 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Padi2Q08642 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Padi2Q08642 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Padi2Q08642 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Padi2Q08642 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Padi2Q08642 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Padi2Q08642 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Padi2Q08642 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Padi2Q08642 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Padi2Q08642 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Padi2Q08642 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Padi2Q08642 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Padi2Q08642 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Padi2Q08642 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Padi2Q08642 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Padi2Q08642 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Padi2Q08642 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Padi2Q08642 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Padi2Q08642 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Padi2Q08642 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Padi2Q08642 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Padi2Q08642 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Padi2Q08642 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Padi2Q08642 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Padi2Q08642 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Padi2Q08642 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Padi2Q08642 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Padi2Q08642 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Padi2Q08642 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Padi2Q08642 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Padi2Q08642 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Padi2Q08642 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Padi2Q08642 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Padi2Q08642 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Padi2Q08642 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Padi2Q08642 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Padi2Q08642 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Padi2Q08642 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Padi2Q08642 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Padi2Q08642 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Padi2Q08642 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.4 ms