Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MINDY3Q9CV28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MINDY3Q9CV28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MINDY3Q9CV28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MINDY3Q9CV28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MINDY3Q9CV28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MINDY3Q9CV28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
MINDY3Q9CV28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
MINDY3Q9CV28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MINDY3Q9CV28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
MINDY3Q9CV28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MINDY3Q9CV28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MINDY3Q9CV28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MINDY3Q9CV28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MINDY3Q9CV28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MINDY3Q9CV28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MINDY3Q9CV28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MINDY3Q9CV28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MINDY3Q9CV28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MINDY3Q9CV28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MINDY3Q9CV28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MINDY3Q9CV28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MINDY3Q9CV28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MINDY3Q9CV28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MINDY3Q9CV28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MINDY3Q9CV28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MINDY3Q9CV28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MINDY3Q9CV28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MINDY3Q9CV28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MINDY3Q9CV28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY3Q9CV28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY3Q9CV28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MINDY3Q9CV28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MINDY3Q9CV28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MINDY3Q9CV28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MINDY3Q9CV28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MINDY3Q9CV28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MINDY3Q9CV28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MINDY3Q9CV28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MINDY3Q9CV28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MINDY3Q9CV28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MINDY3Q9CV28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MINDY3Q9CV28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MINDY3Q9CV28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MINDY3Q9CV28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MINDY3Q9CV28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY3Q9CV28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY3Q9CV28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY3Q9CV28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY3Q9CV28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MINDY3Q9CV28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MINDY3Q9CV28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MINDY3Q9CV28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MINDY3Q9CV28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MINDY3Q9CV28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MINDY3Q9CV28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MINDY3Q9CV28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MINDY3Q9CV28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MINDY3Q9CV28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MINDY3Q9CV28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MINDY3Q9CV28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MINDY3Q9CV28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MINDY3Q9CV28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MINDY3Q9CV28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MINDY3Q9CV28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MINDY3Q9CV28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MINDY3Q9CV28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY3Q9CV28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MINDY3Q9CV28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MINDY3Q9CV28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MINDY3Q9CV28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MINDY3Q9CV28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MINDY3Q9CV28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MINDY3Q9CV28 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MINDY3Q9CV28 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MINDY3Q9CV28 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MINDY3Q9CV28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MINDY3Q9CV28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MINDY3Q9CV28 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MINDY3Q9CV28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MINDY3Q9CV28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MINDY3Q9CV28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MINDY3Q9CV28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MINDY3Q9CV28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MINDY3Q9CV28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MINDY3Q9CV28 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MINDY3Q9CV28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MINDY3Q9CV28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY3Q9CV28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MINDY3Q9CV28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MINDY3Q9CV28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MINDY3Q9CV28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MINDY3Q9CV28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MINDY3Q9CV28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MINDY3Q9CV28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MINDY3Q9CV28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MINDY3Q9CV28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MINDY3Q9CV28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MINDY3Q9CV28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MINDY3Q9CV28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms