Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ap5b1Q3TAP4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ap5b1Q3TAP4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ap5b1Q3TAP4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap5b1Q3TAP4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ap5b1Q3TAP4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap5b1Q3TAP4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap5b1Q3TAP4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap5b1Q3TAP4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ap5b1Q3TAP4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap5b1Q3TAP4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap5b1Q3TAP4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap5b1Q3TAP4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ap5b1Q3TAP4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap5b1Q3TAP4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap5b1Q3TAP4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap5b1Q3TAP4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap5b1Q3TAP4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap5b1Q3TAP4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap5b1Q3TAP4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap5b1Q3TAP4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap5b1Q3TAP4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap5b1Q3TAP4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap5b1Q3TAP4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap5b1Q3TAP4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ap5b1Q3TAP4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap5b1Q3TAP4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap5b1Q3TAP4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap5b1Q3TAP4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap5b1Q3TAP4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap5b1Q3TAP4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap5b1Q3TAP4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap5b1Q3TAP4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap5b1Q3TAP4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap5b1Q3TAP4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap5b1Q3TAP4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap5b1Q3TAP4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap5b1Q3TAP4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap5b1Q3TAP4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap5b1Q3TAP4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap5b1Q3TAP4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap5b1Q3TAP4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap5b1Q3TAP4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap5b1Q3TAP4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap5b1Q3TAP4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap5b1Q3TAP4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap5b1Q3TAP4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap5b1Q3TAP4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap5b1Q3TAP4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ap5b1Q3TAP4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ap5b1Q3TAP4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap5b1Q3TAP4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap5b1Q3TAP4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap5b1Q3TAP4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap5b1Q3TAP4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap5b1Q3TAP4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap5b1Q3TAP4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap5b1Q3TAP4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap5b1Q3TAP4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap5b1Q3TAP4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap5b1Q3TAP4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap5b1Q3TAP4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap5b1Q3TAP4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ap5b1Q3TAP4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap5b1Q3TAP4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap5b1Q3TAP4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap5b1Q3TAP4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap5b1Q3TAP4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap5b1Q3TAP4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap5b1Q3TAP4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap5b1Q3TAP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap5b1Q3TAP4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap5b1Q3TAP4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap5b1Q3TAP4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap5b1Q3TAP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap5b1Q3TAP4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap5b1Q3TAP4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap5b1Q3TAP4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap5b1Q3TAP4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap5b1Q3TAP4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap5b1Q3TAP4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap5b1Q3TAP4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap5b1Q3TAP4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap5b1Q3TAP4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ap5b1Q3TAP4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap5b1Q3TAP4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap5b1Q3TAP4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap5b1Q3TAP4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap5b1Q3TAP4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap5b1Q3TAP4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap5b1Q3TAP4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap5b1Q3TAP4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap5b1Q3TAP4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap5b1Q3TAP4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap5b1Q3TAP4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap5b1Q3TAP4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap5b1Q3TAP4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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