Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL35

Magix, PDZ domain-containing protein MAGIX, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MagixQ4KL35 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MagixQ4KL35 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
MagixQ4KL35 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MagixQ4KL35 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MagixQ4KL35 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
MagixQ4KL35 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MagixQ4KL35 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MagixQ4KL35 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MagixQ4KL35 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MagixQ4KL35 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MagixQ4KL35 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MagixQ4KL35 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MagixQ4KL35 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MagixQ4KL35 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MagixQ4KL35 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MagixQ4KL35 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MagixQ4KL35 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MagixQ4KL35 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MagixQ4KL35 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MagixQ4KL35 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MagixQ4KL35 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MagixQ4KL35 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MagixQ4KL35 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MagixQ4KL35 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MagixQ4KL35 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MagixQ4KL35 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MagixQ4KL35 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MagixQ4KL35 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MagixQ4KL35 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MagixQ4KL35 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MagixQ4KL35 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MagixQ4KL35 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MagixQ4KL35 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MagixQ4KL35 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MagixQ4KL35 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MagixQ4KL35 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MagixQ4KL35 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MagixQ4KL35 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MagixQ4KL35 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MagixQ4KL35 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MagixQ4KL35 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MagixQ4KL35 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MagixQ4KL35 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MagixQ4KL35 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MagixQ4KL35 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MagixQ4KL35 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MagixQ4KL35 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MagixQ4KL35 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MagixQ4KL35 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MagixQ4KL35 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MagixQ4KL35 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MagixQ4KL35 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MagixQ4KL35 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MagixQ4KL35 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MagixQ4KL35 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MagixQ4KL35 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MagixQ4KL35 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MagixQ4KL35 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MagixQ4KL35 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MagixQ4KL35 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MagixQ4KL35 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MagixQ4KL35 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
MagixQ4KL35 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MagixQ4KL35 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MagixQ4KL35 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MagixQ4KL35 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MagixQ4KL35 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MagixQ4KL35 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MagixQ4KL35 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MagixQ4KL35 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MagixQ4KL35 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MagixQ4KL35 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MagixQ4KL35 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MagixQ4KL35 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MagixQ4KL35 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MagixQ4KL35 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MagixQ4KL35 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MagixQ4KL35 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MagixQ4KL35 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MagixQ4KL35 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MagixQ4KL35 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MagixQ4KL35 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MagixQ4KL35 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MagixQ4KL35 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MagixQ4KL35 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MagixQ4KL35 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MagixQ4KL35 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MagixQ4KL35 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MagixQ4KL35 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MagixQ4KL35 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MagixQ4KL35 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MagixQ4KL35 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MagixQ4KL35 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MagixQ4KL35 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MagixQ4KL35 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MagixQ4KL35 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MagixQ4KL35 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MagixQ4KL35 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MagixQ4KL35 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MagixQ4KL35 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms