Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Vat1Q62465 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Vat1Q62465 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Vat1Q62465 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Vat1Q62465 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Vat1Q62465 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Vat1Q62465 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Vat1Q62465 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vat1Q62465 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Vat1Q62465 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Vat1Q62465 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vat1Q62465 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vat1Q62465 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Vat1Q62465 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Vat1Q62465 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vat1Q62465 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Vat1Q62465 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Vat1Q62465 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vat1Q62465 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Vat1Q62465 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Vat1Q62465 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vat1Q62465 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Vat1Q62465 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Vat1Q62465 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vat1Q62465 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vat1Q62465 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Vat1Q62465 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Vat1Q62465 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vat1Q62465 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Vat1Q62465 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vat1Q62465 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Vat1Q62465 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vat1Q62465 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vat1Q62465 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vat1Q62465 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Vat1Q62465 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vat1Q62465 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vat1Q62465 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vat1Q62465 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vat1Q62465 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vat1Q62465 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vat1Q62465 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vat1Q62465 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vat1Q62465 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vat1Q62465 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vat1Q62465 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vat1Q62465 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Vat1Q62465 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vat1Q62465 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vat1Q62465 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vat1Q62465 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vat1Q62465 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vat1Q62465 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vat1Q62465 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vat1Q62465 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vat1Q62465 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vat1Q62465 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vat1Q62465 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vat1Q62465 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vat1Q62465 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vat1Q62465 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vat1Q62465 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vat1Q62465 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Vat1Q62465 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vat1Q62465 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vat1Q62465 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vat1Q62465 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vat1Q62465 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vat1Q62465 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vat1Q62465 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vat1Q62465 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vat1Q62465 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vat1Q62465 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vat1Q62465 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vat1Q62465 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vat1Q62465 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vat1Q62465 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vat1Q62465 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vat1Q62465 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vat1Q62465 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vat1Q62465 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vat1Q62465 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vat1Q62465 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vat1Q62465 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vat1Q62465 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vat1Q62465 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vat1Q62465 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Vat1Q62465 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vat1Q62465 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Vat1Q62465 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vat1Q62465 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vat1Q62465 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vat1Q62465 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vat1Q62465 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Vat1Q62465 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vat1Q62465 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vat1Q62465 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vat1Q62465 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Vat1Q62465 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vat1Q62465 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms