Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,66■■■■■ 4,9
Col26a1Q91VF6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Col26a1Q91VF6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,25■■■■■ 4,35
Col26a1Q91VF6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Col26a1Q91VF6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Col26a1Q91VF6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Col26a1Q91VF6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Col26a1Q91VF6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Col26a1Q91VF6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,3■■■■□ 3,72
Col26a1Q91VF6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,26■■■■□ 3,72
Col26a1Q91VF6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Col26a1Q91VF6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,08■■■■□ 3,69
Col26a1Q91VF6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Col26a1Q91VF6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Col26a1Q91VF6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Col26a1Q91VF6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Col26a1Q91VF6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Col26a1Q91VF6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Col26a1Q91VF6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,56■■■■□ 3,44
Col26a1Q91VF6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Col26a1Q91VF6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Col26a1Q91VF6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3,35
Col26a1Q91VF6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Col26a1Q91VF6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Col26a1Q91VF6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Col26a1Q91VF6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Col26a1Q91VF6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Col26a1Q91VF6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
Col26a1Q91VF6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,65■■■■□ 3,3
Col26a1Q91VF6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,53■■■■□ 3,28
Col26a1Q91VF6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Col26a1Q91VF6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,24■■■■□ 3,23
Col26a1Q91VF6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Col26a1Q91VF6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Col26a1Q91VF6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Col26a1Q91VF6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Col26a1Q91VF6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Col26a1Q91VF6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Col26a1Q91VF6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Col26a1Q91VF6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Col26a1Q91VF6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Col26a1Q91VF6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Col26a1Q91VF6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Col26a1Q91VF6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Col26a1Q91VF6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Col26a1Q91VF6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Col26a1Q91VF6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Col26a1Q91VF6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Col26a1Q91VF6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Col26a1Q91VF6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Col26a1Q91VF6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Col26a1Q91VF6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Col26a1Q91VF6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Col26a1Q91VF6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Col26a1Q91VF6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Col26a1Q91VF6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Col26a1Q91VF6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Col26a1Q91VF6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Col26a1Q91VF6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Col26a1Q91VF6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Col26a1Q91VF6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Col26a1Q91VF6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Col26a1Q91VF6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Col26a1Q91VF6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Col26a1Q91VF6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Col26a1Q91VF6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Col26a1Q91VF6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Col26a1Q91VF6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Col26a1Q91VF6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Col26a1Q91VF6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
Col26a1Q91VF6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Col26a1Q91VF6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Col26a1Q91VF6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Col26a1Q91VF6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Col26a1Q91VF6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Col26a1Q91VF6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Col26a1Q91VF6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Col26a1Q91VF6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Col26a1Q91VF6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Col26a1Q91VF6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Col26a1Q91VF6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Col26a1Q91VF6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Col26a1Q91VF6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Col26a1Q91VF6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Col26a1Q91VF6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Col26a1Q91VF6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Col26a1Q91VF6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Col26a1Q91VF6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Col26a1Q91VF6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Col26a1Q91VF6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Col26a1Q91VF6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Col26a1Q91VF6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Col26a1Q91VF6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Col26a1Q91VF6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Col26a1Q91VF6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Col26a1Q91VF6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Col26a1Q91VF6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Col26a1Q91VF6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Col26a1Q91VF6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Col26a1Q91VF6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms