Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUZ3

Tigd4, Tigger transposable element-derived protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd4Q8BUZ3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Tigd4Q8BUZ3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tigd4Q8BUZ3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tigd4Q8BUZ3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tigd4Q8BUZ3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Tigd4Q8BUZ3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tigd4Q8BUZ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tigd4Q8BUZ3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tigd4Q8BUZ3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tigd4Q8BUZ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tigd4Q8BUZ3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tigd4Q8BUZ3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tigd4Q8BUZ3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tigd4Q8BUZ3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tigd4Q8BUZ3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tigd4Q8BUZ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tigd4Q8BUZ3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tigd4Q8BUZ3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tigd4Q8BUZ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tigd4Q8BUZ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tigd4Q8BUZ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tigd4Q8BUZ3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tigd4Q8BUZ3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tigd4Q8BUZ3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tigd4Q8BUZ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tigd4Q8BUZ3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tigd4Q8BUZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tigd4Q8BUZ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tigd4Q8BUZ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tigd4Q8BUZ3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tigd4Q8BUZ3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tigd4Q8BUZ3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tigd4Q8BUZ3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tigd4Q8BUZ3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tigd4Q8BUZ3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tigd4Q8BUZ3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tigd4Q8BUZ3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tigd4Q8BUZ3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tigd4Q8BUZ3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tigd4Q8BUZ3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tigd4Q8BUZ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tigd4Q8BUZ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tigd4Q8BUZ3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tigd4Q8BUZ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tigd4Q8BUZ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tigd4Q8BUZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tigd4Q8BUZ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tigd4Q8BUZ3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tigd4Q8BUZ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tigd4Q8BUZ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tigd4Q8BUZ3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tigd4Q8BUZ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tigd4Q8BUZ3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tigd4Q8BUZ3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tigd4Q8BUZ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tigd4Q8BUZ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tigd4Q8BUZ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tigd4Q8BUZ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tigd4Q8BUZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tigd4Q8BUZ3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tigd4Q8BUZ3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tigd4Q8BUZ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tigd4Q8BUZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tigd4Q8BUZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tigd4Q8BUZ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tigd4Q8BUZ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tigd4Q8BUZ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tigd4Q8BUZ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tigd4Q8BUZ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tigd4Q8BUZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tigd4Q8BUZ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tigd4Q8BUZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tigd4Q8BUZ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tigd4Q8BUZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tigd4Q8BUZ3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tigd4Q8BUZ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tigd4Q8BUZ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tigd4Q8BUZ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tigd4Q8BUZ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tigd4Q8BUZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tigd4Q8BUZ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tigd4Q8BUZ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tigd4Q8BUZ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tigd4Q8BUZ3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tigd4Q8BUZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tigd4Q8BUZ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tigd4Q8BUZ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tigd4Q8BUZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd4Q8BUZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tigd4Q8BUZ3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tigd4Q8BUZ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tigd4Q8BUZ3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tigd4Q8BUZ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tigd4Q8BUZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms