RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sema3gQ4LFA9 780 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phf12Q5SPL2 1003 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr320Q7TRZ4 306 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pcdh19Q80TF3 1145 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim36Q80WG7 729 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bbs4Q8C1Z7 520 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifnl3Q8CGK6 193 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ly6g6eQ8K1T6 166 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Oard1Q8R5F3 152 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Asf1aQ9CQE6 204 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcm8Q9CWV1 833 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tex22Q9D9U4 189 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zswim2Q9D9X6 631 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mmp19Q9JHI0 527 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spry4Q9WTP2 300 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpx5P21765 221 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgap39P59281 1107 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ypel5P62700 121 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ap5b1Q3TAP4 876 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem38aQ3TMP8 298 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5460Q3UQ97 254 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zmat1Q3V0C1 714 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q8BL95 290 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gtf2h3Q8VD76 309 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1093Q8VF14 322 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9D3J9 298 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sphk2Q9JIA7 617 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm14147A2AQX6 640 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 S100zB9EJL3 99 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BC051665E9Q623 330 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NagluO88325 739 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hipk1O88904 1210 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mtnd3P03899 115 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MbP04247 154 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nid1P10493 1245 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 EnpepP16406 945 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Apoa1Q00623 264 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tstd2Q3U269 495 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HjurpQ6PG16 667 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tprg1Q8CB49 279 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Piwil4Q8CGT6 848 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cadm4Q8R464 388 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr315Q8VFG7 309 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Asb17Q8VHP9 295 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hhipl2Q9D2G9 717 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sppl2aQ9JJF9 523 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phc2Q9QWH1 850 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gdf2Q9WV56 428 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dock6Q8VDR9 2080 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pkd2l1A2A259 760 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phf11cB4XVP9 339 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MndaP0DOV1 425 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 UoxP25688 303 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrm3Q5ND52 418 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1288Q7TQY0 312 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr128Q7TRJ1 308 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krt75Q8BGZ7 551 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eme1Q8BJW7 570 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nprl3Q8VIJ8 569 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpe65Q91ZQ5 533 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 EtfaQ99LC5 333 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam69bQ99ML4 431 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifi44lQ9BDB7 447 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdelr2Q9CQM2 212 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pgm3Q9CYR6 542 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pp2d1Q8BVT6 620 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpr18Q8K1Z6 331 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vps4aQ8VEJ9 437 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klk6Q91Y82 253 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnase2bQ9QY48 354 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm13420A0A140LJJ2 248 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5152L7N200 190 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01654 111 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01656 111 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P03977 111 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GypaP14220 168 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc6a11P31650 627 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Inf2Q0GNC1 1273 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lurap1lQ8K2P1 221 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r215Q8R264 300 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif3mQ99JX4 374 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Agpat5Q9D1E8 365 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp352A2AML7 551 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hax1O35387 280 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tgfb3P17125 410 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tacr2P30549 384 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.5 ms