Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ifnl3Q8CGK6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ifnl3Q8CGK6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ifnl3Q8CGK6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ifnl3Q8CGK6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ifnl3Q8CGK6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ifnl3Q8CGK6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ifnl3Q8CGK6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ifnl3Q8CGK6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ifnl3Q8CGK6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ifnl3Q8CGK6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ifnl3Q8CGK6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ifnl3Q8CGK6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ifnl3Q8CGK6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ifnl3Q8CGK6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ifnl3Q8CGK6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ifnl3Q8CGK6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ifnl3Q8CGK6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ifnl3Q8CGK6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ifnl3Q8CGK6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ifnl3Q8CGK6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ifnl3Q8CGK6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ifnl3Q8CGK6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ifnl3Q8CGK6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ifnl3Q8CGK6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ifnl3Q8CGK6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ifnl3Q8CGK6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ifnl3Q8CGK6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ifnl3Q8CGK6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ifnl3Q8CGK6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ifnl3Q8CGK6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ifnl3Q8CGK6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ifnl3Q8CGK6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ifnl3Q8CGK6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ifnl3Q8CGK6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ifnl3Q8CGK6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ifnl3Q8CGK6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ifnl3Q8CGK6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ifnl3Q8CGK6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ifnl3Q8CGK6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ifnl3Q8CGK6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ifnl3Q8CGK6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ifnl3Q8CGK6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ifnl3Q8CGK6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifnl3Q8CGK6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifnl3Q8CGK6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifnl3Q8CGK6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ifnl3Q8CGK6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ifnl3Q8CGK6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifnl3Q8CGK6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnl3Q8CGK6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ifnl3Q8CGK6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ifnl3Q8CGK6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ifnl3Q8CGK6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnl3Q8CGK6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ifnl3Q8CGK6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ifnl3Q8CGK6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ifnl3Q8CGK6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ifnl3Q8CGK6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnl3Q8CGK6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ifnl3Q8CGK6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ifnl3Q8CGK6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ifnl3Q8CGK6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ifnl3Q8CGK6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ifnl3Q8CGK6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ifnl3Q8CGK6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifnl3Q8CGK6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ifnl3Q8CGK6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ifnl3Q8CGK6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifnl3Q8CGK6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ifnl3Q8CGK6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifnl3Q8CGK6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ifnl3Q8CGK6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifnl3Q8CGK6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifnl3Q8CGK6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifnl3Q8CGK6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifnl3Q8CGK6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifnl3Q8CGK6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifnl3Q8CGK6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifnl3Q8CGK6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifnl3Q8CGK6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifnl3Q8CGK6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifnl3Q8CGK6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ifnl3Q8CGK6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ifnl3Q8CGK6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifnl3Q8CGK6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifnl3Q8CGK6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifnl3Q8CGK6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ifnl3Q8CGK6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ifnl3Q8CGK6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ifnl3Q8CGK6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifnl3Q8CGK6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnl3Q8CGK6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnl3Q8CGK6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnl3Q8CGK6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ifnl3Q8CGK6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ifnl3Q8CGK6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ifnl3Q8CGK6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ifnl3Q8CGK6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ifnl3Q8CGK6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms