Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,6■■■■□ 3,45
Tacr2P30549 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Tacr2P30549 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Tacr2P30549 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Tacr2P30549 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Tacr2P30549 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Tacr2P30549 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Tacr2P30549 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Tacr2P30549 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,38■■■□□ 2,61
Tacr2P30549 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Tacr2P30549 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Tacr2P30549 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Tacr2P30549 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Tacr2P30549 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Tacr2P30549 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Tacr2P30549 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Tacr2P30549 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Tacr2P30549 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Tacr2P30549 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tacr2P30549 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Tacr2P30549 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Tacr2P30549 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Tacr2P30549 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tacr2P30549 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tacr2P30549 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tacr2P30549 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tacr2P30549 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tacr2P30549 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Tacr2P30549 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tacr2P30549 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tacr2P30549 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tacr2P30549 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Tacr2P30549 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tacr2P30549 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tacr2P30549 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tacr2P30549 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tacr2P30549 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Tacr2P30549 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tacr2P30549 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Tacr2P30549 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tacr2P30549 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Tacr2P30549 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Tacr2P30549 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Tacr2P30549 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Tacr2P30549 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tacr2P30549 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tacr2P30549 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Tacr2P30549 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tacr2P30549 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tacr2P30549 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tacr2P30549 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tacr2P30549 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tacr2P30549 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tacr2P30549 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tacr2P30549 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tacr2P30549 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tacr2P30549 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Tacr2P30549 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tacr2P30549 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tacr2P30549 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Tacr2P30549 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tacr2P30549 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tacr2P30549 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Tacr2P30549 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
Tacr2P30549 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tacr2P30549 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tacr2P30549 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Tacr2P30549 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Tacr2P30549 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Tacr2P30549 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Tacr2P30549 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Tacr2P30549 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Tacr2P30549 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Tacr2P30549 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Tacr2P30549 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Tacr2P30549 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
Tacr2P30549 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Tacr2P30549 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Tacr2P30549 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Tacr2P30549 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Tacr2P30549 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Tacr2P30549 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Tacr2P30549 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Tacr2P30549 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Tacr2P30549 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Tacr2P30549 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Tacr2P30549 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tacr2P30549 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Tacr2P30549 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Tacr2P30549 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Tacr2P30549 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
Tacr2P30549 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tacr2P30549 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tacr2P30549 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tacr2P30549 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tacr2P30549 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tacr2P30549 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tacr2P30549 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tacr2P30549 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tacr2P30549 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms