Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Apoa1Q00623 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Apoa1Q00623 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Apoa1Q00623 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Apoa1Q00623 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Apoa1Q00623 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Apoa1Q00623 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apoa1Q00623 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Apoa1Q00623 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apoa1Q00623 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Apoa1Q00623 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Apoa1Q00623 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Apoa1Q00623 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apoa1Q00623 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apoa1Q00623 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Apoa1Q00623 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apoa1Q00623 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apoa1Q00623 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Apoa1Q00623 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apoa1Q00623 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apoa1Q00623 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apoa1Q00623 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apoa1Q00623 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apoa1Q00623 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apoa1Q00623 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Apoa1Q00623 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apoa1Q00623 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apoa1Q00623 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apoa1Q00623 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apoa1Q00623 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apoa1Q00623 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apoa1Q00623 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Apoa1Q00623 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apoa1Q00623 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Apoa1Q00623 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apoa1Q00623 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apoa1Q00623 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apoa1Q00623 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apoa1Q00623 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Apoa1Q00623 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apoa1Q00623 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apoa1Q00623 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apoa1Q00623 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apoa1Q00623 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Apoa1Q00623 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apoa1Q00623 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apoa1Q00623 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apoa1Q00623 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apoa1Q00623 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apoa1Q00623 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apoa1Q00623 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apoa1Q00623 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Apoa1Q00623 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Apoa1Q00623 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Apoa1Q00623 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apoa1Q00623 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apoa1Q00623 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apoa1Q00623 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apoa1Q00623 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apoa1Q00623 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apoa1Q00623 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Apoa1Q00623 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apoa1Q00623 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apoa1Q00623 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apoa1Q00623 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apoa1Q00623 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apoa1Q00623 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apoa1Q00623 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apoa1Q00623 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apoa1Q00623 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apoa1Q00623 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apoa1Q00623 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apoa1Q00623 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apoa1Q00623 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apoa1Q00623 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apoa1Q00623 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apoa1Q00623 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apoa1Q00623 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apoa1Q00623 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apoa1Q00623 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apoa1Q00623 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apoa1Q00623 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apoa1Q00623 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apoa1Q00623 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apoa1Q00623 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apoa1Q00623 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apoa1Q00623 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apoa1Q00623 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apoa1Q00623 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apoa1Q00623 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apoa1Q00623 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apoa1Q00623 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apoa1Q00623 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apoa1Q00623 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apoa1Q00623 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoa1Q00623 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoa1Q00623 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoa1Q00623 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apoa1Q00623 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apoa1Q00623 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms