Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Apoa1Q00623 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Apoa1Q00623 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Apoa1Q00623 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Apoa1Q00623 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,39■■■□□ 2,45
Apoa1Q00623 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Apoa1Q00623 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Apoa1Q00623 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Apoa1Q00623 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Apoa1Q00623 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Apoa1Q00623 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Apoa1Q00623 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Apoa1Q00623 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Apoa1Q00623 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Apoa1Q00623 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Apoa1Q00623 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Apoa1Q00623 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Apoa1Q00623 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Apoa1Q00623 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Apoa1Q00623 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Apoa1Q00623 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Apoa1Q00623 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Apoa1Q00623 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Apoa1Q00623 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Apoa1Q00623 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Apoa1Q00623 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Apoa1Q00623 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Apoa1Q00623 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Apoa1Q00623 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Apoa1Q00623 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Apoa1Q00623 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Apoa1Q00623 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Apoa1Q00623 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Apoa1Q00623 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Apoa1Q00623 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Apoa1Q00623 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Apoa1Q00623 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Apoa1Q00623 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Apoa1Q00623 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Apoa1Q00623 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Apoa1Q00623 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Apoa1Q00623 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Apoa1Q00623 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Apoa1Q00623 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Apoa1Q00623 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Apoa1Q00623 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Apoa1Q00623 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Apoa1Q00623 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Apoa1Q00623 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Apoa1Q00623 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Apoa1Q00623 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Apoa1Q00623 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Apoa1Q00623 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Apoa1Q00623 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Apoa1Q00623 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Apoa1Q00623 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Apoa1Q00623 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Apoa1Q00623 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Apoa1Q00623 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Apoa1Q00623 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Apoa1Q00623 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Apoa1Q00623 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Apoa1Q00623 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Apoa1Q00623 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Apoa1Q00623 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Apoa1Q00623 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Apoa1Q00623 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Apoa1Q00623 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Apoa1Q00623 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Apoa1Q00623 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Apoa1Q00623 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Apoa1Q00623 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Apoa1Q00623 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Apoa1Q00623 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Apoa1Q00623 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Apoa1Q00623 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Apoa1Q00623 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Apoa1Q00623 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Apoa1Q00623 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Apoa1Q00623 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Apoa1Q00623 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Apoa1Q00623 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Apoa1Q00623 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Apoa1Q00623 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Apoa1Q00623 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Apoa1Q00623 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Apoa1Q00623 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Apoa1Q00623 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Apoa1Q00623 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Apoa1Q00623 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Apoa1Q00623 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Apoa1Q00623 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Apoa1Q00623 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Apoa1Q00623 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Apoa1Q00623 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Apoa1Q00623 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Apoa1Q00623 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Apoa1Q00623 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Apoa1Q00623 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Apoa1Q00623 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms