Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Nid1P10493 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nid1P10493 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nid1P10493 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nid1P10493 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nid1P10493 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nid1P10493 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Nid1P10493 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Nid1P10493 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nid1P10493 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Nid1P10493 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nid1P10493 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid1P10493 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nid1P10493 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nid1P10493 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid1P10493 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nid1P10493 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nid1P10493 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nid1P10493 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nid1P10493 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nid1P10493 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nid1P10493 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nid1P10493 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nid1P10493 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nid1P10493 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nid1P10493 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nid1P10493 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid1P10493 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nid1P10493 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nid1P10493 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nid1P10493 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nid1P10493 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nid1P10493 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nid1P10493 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nid1P10493 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid1P10493 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nid1P10493 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid1P10493 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nid1P10493 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nid1P10493 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nid1P10493 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nid1P10493 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nid1P10493 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid1P10493 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nid1P10493 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nid1P10493 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nid1P10493 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid1P10493 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid1P10493 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nid1P10493 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nid1P10493 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nid1P10493 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nid1P10493 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nid1P10493 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nid1P10493 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nid1P10493 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nid1P10493 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nid1P10493 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nid1P10493 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nid1P10493 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid1P10493 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid1P10493 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid1P10493 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid1P10493 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid1P10493 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nid1P10493 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nid1P10493 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid1P10493 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nid1P10493 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nid1P10493 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nid1P10493 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nid1P10493 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nid1P10493 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid1P10493 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid1P10493 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid1P10493 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid1P10493 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid1P10493 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid1P10493 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid1P10493 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid1P10493 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid1P10493 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nid1P10493 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nid1P10493 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nid1P10493 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nid1P10493 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nid1P10493 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nid1P10493 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nid1P10493 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nid1P10493 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nid1P10493 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nid1P10493 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nid1P10493 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nid1P10493 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nid1P10493 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nid1P10493 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nid1P10493 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nid1P10493 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nid1P10493 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nid1P10493 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms