RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl8a2O54832 240 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nipsnap2O55126 281 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gap43P06837 227 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Alas2P08680 587 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifngr1P15261 477 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctps2P70303 586 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irgm1Q60766 409 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pou4f2Q63934 411 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc25a40Q8BGP6 337 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cplx3Q8R1B5 158 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BsndQ8VIM4 307 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3bp4Q921I6 962 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grk2Q99MK8 689 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EbplQ9D0P0 206 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chp2Q9D869 196 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nacc2Q9DCM7 586 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C1qtnf3Q9ES30 246 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PigqQ9QYT7 581 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Itgb6Q9Z0T9 787 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TprF6ZDS4 2431 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4930595M18RikA2RRY9 829 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vsig10lD3YZF7 868 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NsmafO35242 920 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aff2O55112 1272 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Casp8O89110 480 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxd9P28357 339 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adra2bP30545 450 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prim2P33610 505 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jak1P52332 1153 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zic2Q62520 530 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cpsf6Q6NVF9 551 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mup21Q80YX8 181 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atg4dQ8BGV9 474 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam92aQ8BP22 355 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cops7bQ8BV13 264 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uts2rQ8VIH9 385 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem35aQ9D328 167 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MefvQ9JJ26 767 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1508Q9R0K4 310 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eci2Q9WUR2 391 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cldn9Q9Z0S7 217 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Greb1Q3UHK3 1954 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col6a6Q8C6K9 2265 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc62E9PVD1 701 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Catsperg1E9Q355 1151 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4933403O08RikF6UK53 379 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxw15L7N1X6 466 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hsd3b1P24815 373 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dppa5bP85965 119 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csn1s2aQ02862 184 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcl2a1bQ497M6 172 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr39Q5U431 456 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr10Q60883 311 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dlx3Q64205 287 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TufmQ8BFR5 452 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gramd4Q8CB44 633 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sertm1Q8CD78 107 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PgdQ9DCD0 483 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KelQ9EQF2 713 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl3c1Q9QUN5 212 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf11Q9QYK7 154 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lhx6Q9R1R0 363 aa21.43■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdh17E9PXF0 1157 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nfatc2ipO09130 412 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dscr3O35075 297 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apoa4P06728 395 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ChgbP16014 677 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Inpp1P49442 396 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnab3P97382 249 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnc2Q14B80 642 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam189a1Q6A044 515 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Man1c1Q6NXK9 625 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sp110Q8BVK9 445 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r193Q8R258 319 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcoln3Q8R4F0 553 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Foxp3Q99JB6 429 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tex19.1Q99MV2 351 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnot11Q9CWN7 505 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dusp13Q9QYJ7 198 aa21.42■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8251F6VUT6 1994 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssxb6A2BI74 170 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm340F6RGI3 1242 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RbpjlO08674 515 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agtr2P35374 363 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Impdh1P50096 514 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myl2P51667 166 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Traf6P70196 530 aa21.41■■□□□ 1.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc30a3P97441 388 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms