Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT3

Rps6ka2, Ribosomal protein S6 kinase alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka2Q9WUT3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rps6ka2Q9WUT3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rps6ka2Q9WUT3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rps6ka2Q9WUT3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rps6ka2Q9WUT3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rps6ka2Q9WUT3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Rps6ka2Q9WUT3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rps6ka2Q9WUT3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rps6ka2Q9WUT3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Rps6ka2Q9WUT3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rps6ka2Q9WUT3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rps6ka2Q9WUT3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rps6ka2Q9WUT3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Rps6ka2Q9WUT3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rps6ka2Q9WUT3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rps6ka2Q9WUT3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rps6ka2Q9WUT3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rps6ka2Q9WUT3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka2Q9WUT3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rps6ka2Q9WUT3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rps6ka2Q9WUT3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rps6ka2Q9WUT3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rps6ka2Q9WUT3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rps6ka2Q9WUT3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka2Q9WUT3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka2Q9WUT3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rps6ka2Q9WUT3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rps6ka2Q9WUT3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rps6ka2Q9WUT3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rps6ka2Q9WUT3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rps6ka2Q9WUT3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka2Q9WUT3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rps6ka2Q9WUT3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rps6ka2Q9WUT3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rps6ka2Q9WUT3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rps6ka2Q9WUT3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rps6ka2Q9WUT3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka2Q9WUT3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rps6ka2Q9WUT3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rps6ka2Q9WUT3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rps6ka2Q9WUT3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rps6ka2Q9WUT3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rps6ka2Q9WUT3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rps6ka2Q9WUT3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rps6ka2Q9WUT3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rps6ka2Q9WUT3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rps6ka2Q9WUT3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka2Q9WUT3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka2Q9WUT3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rps6ka2Q9WUT3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka2Q9WUT3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka2Q9WUT3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6ka2Q9WUT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6ka2Q9WUT3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6ka2Q9WUT3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka2Q9WUT3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rps6ka2Q9WUT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka2Q9WUT3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka2Q9WUT3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6ka2Q9WUT3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka2Q9WUT3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka2Q9WUT3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka2Q9WUT3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka2Q9WUT3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka2Q9WUT3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rps6ka2Q9WUT3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6ka2Q9WUT3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rps6ka2Q9WUT3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rps6ka2Q9WUT3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6ka2Q9WUT3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rps6ka2Q9WUT3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rps6ka2Q9WUT3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6ka2Q9WUT3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rps6ka2Q9WUT3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rps6ka2Q9WUT3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rps6ka2Q9WUT3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka2Q9WUT3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka2Q9WUT3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka2Q9WUT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6ka2Q9WUT3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6ka2Q9WUT3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6ka2Q9WUT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps6ka2Q9WUT3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6ka2Q9WUT3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6ka2Q9WUT3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6ka2Q9WUT3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6ka2Q9WUT3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps6ka2Q9WUT3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6ka2Q9WUT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka2Q9WUT3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka2Q9WUT3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka2Q9WUT3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka2Q9WUT3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka2Q9WUT3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka2Q9WUT3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka2Q9WUT3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka2Q9WUT3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka2Q9WUT3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms