Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,56■■■■□ 3,28
Itgb6Q9Z0T9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Itgb6Q9Z0T9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Itgb6Q9Z0T9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Itgb6Q9Z0T9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Itgb6Q9Z0T9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Itgb6Q9Z0T9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Itgb6Q9Z0T9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Itgb6Q9Z0T9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Itgb6Q9Z0T9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Itgb6Q9Z0T9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Itgb6Q9Z0T9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Itgb6Q9Z0T9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Itgb6Q9Z0T9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Itgb6Q9Z0T9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Itgb6Q9Z0T9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Itgb6Q9Z0T9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Itgb6Q9Z0T9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Itgb6Q9Z0T9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Itgb6Q9Z0T9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Itgb6Q9Z0T9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Itgb6Q9Z0T9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Itgb6Q9Z0T9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Itgb6Q9Z0T9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Itgb6Q9Z0T9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Itgb6Q9Z0T9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,89■■■□□ 2,21
Itgb6Q9Z0T9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Itgb6Q9Z0T9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Itgb6Q9Z0T9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Itgb6Q9Z0T9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Itgb6Q9Z0T9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Itgb6Q9Z0T9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Itgb6Q9Z0T9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Itgb6Q9Z0T9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Itgb6Q9Z0T9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Itgb6Q9Z0T9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Itgb6Q9Z0T9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Itgb6Q9Z0T9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Itgb6Q9Z0T9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Itgb6Q9Z0T9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Itgb6Q9Z0T9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Itgb6Q9Z0T9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Itgb6Q9Z0T9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Itgb6Q9Z0T9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Itgb6Q9Z0T9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Itgb6Q9Z0T9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Itgb6Q9Z0T9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Itgb6Q9Z0T9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Itgb6Q9Z0T9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Itgb6Q9Z0T9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Itgb6Q9Z0T9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Itgb6Q9Z0T9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Itgb6Q9Z0T9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Itgb6Q9Z0T9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Itgb6Q9Z0T9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Itgb6Q9Z0T9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Itgb6Q9Z0T9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Itgb6Q9Z0T9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Itgb6Q9Z0T9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Itgb6Q9Z0T9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Itgb6Q9Z0T9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Itgb6Q9Z0T9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Itgb6Q9Z0T9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Itgb6Q9Z0T9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Itgb6Q9Z0T9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Itgb6Q9Z0T9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Itgb6Q9Z0T9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Itgb6Q9Z0T9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Itgb6Q9Z0T9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Itgb6Q9Z0T9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Itgb6Q9Z0T9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Itgb6Q9Z0T9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Itgb6Q9Z0T9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Itgb6Q9Z0T9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Itgb6Q9Z0T9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Itgb6Q9Z0T9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Itgb6Q9Z0T9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Itgb6Q9Z0T9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Itgb6Q9Z0T9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Itgb6Q9Z0T9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Itgb6Q9Z0T9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgb6Q9Z0T9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgb6Q9Z0T9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itgb6Q9Z0T9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itgb6Q9Z0T9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Itgb6Q9Z0T9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Itgb6Q9Z0T9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Itgb6Q9Z0T9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Itgb6Q9Z0T9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Itgb6Q9Z0T9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Itgb6Q9Z0T9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Itgb6Q9Z0T9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Itgb6Q9Z0T9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms