Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,52■■■■□ 3,28
Casp8O89110 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Casp8O89110 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Casp8O89110 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Casp8O89110 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Casp8O89110 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Casp8O89110 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Casp8O89110 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Casp8O89110 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Casp8O89110 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Casp8O89110 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Casp8O89110 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Casp8O89110 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Casp8O89110 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Casp8O89110 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Casp8O89110 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Casp8O89110 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Casp8O89110 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Casp8O89110 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Casp8O89110 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Casp8O89110 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Casp8O89110 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Casp8O89110 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Casp8O89110 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Casp8O89110 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Casp8O89110 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Casp8O89110 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Casp8O89110 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Casp8O89110 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Casp8O89110 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Casp8O89110 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Casp8O89110 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Casp8O89110 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Casp8O89110 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Casp8O89110 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Casp8O89110 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Casp8O89110 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Casp8O89110 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Casp8O89110 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Casp8O89110 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Casp8O89110 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Casp8O89110 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Casp8O89110 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Casp8O89110 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Casp8O89110 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Casp8O89110 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Casp8O89110 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Casp8O89110 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Casp8O89110 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Casp8O89110 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Casp8O89110 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Casp8O89110 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Casp8O89110 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Casp8O89110 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Casp8O89110 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Casp8O89110 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Casp8O89110 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Casp8O89110 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Casp8O89110 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Casp8O89110 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Casp8O89110 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Casp8O89110 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Casp8O89110 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Casp8O89110 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Casp8O89110 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Casp8O89110 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Casp8O89110 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Casp8O89110 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Casp8O89110 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Casp8O89110 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Casp8O89110 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Casp8O89110 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Casp8O89110 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Casp8O89110 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Casp8O89110 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Casp8O89110 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Casp8O89110 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Casp8O89110 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Casp8O89110 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Casp8O89110 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Casp8O89110 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Casp8O89110 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Casp8O89110 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Casp8O89110 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Casp8O89110 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Casp8O89110 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Casp8O89110 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Casp8O89110 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Casp8O89110 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Casp8O89110 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Casp8O89110 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Casp8O89110 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Casp8O89110 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Casp8O89110 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Casp8O89110 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Casp8O89110 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Casp8O89110 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Casp8O89110 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Casp8O89110 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Casp8O89110 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms