Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Casp8O89110 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Casp8O89110 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Casp8O89110 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Casp8O89110 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Casp8O89110 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Casp8O89110 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Casp8O89110 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Casp8O89110 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Casp8O89110 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Casp8O89110 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Casp8O89110 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Casp8O89110 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Casp8O89110 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Casp8O89110 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Casp8O89110 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Casp8O89110 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Casp8O89110 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Casp8O89110 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Casp8O89110 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Casp8O89110 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Casp8O89110 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Casp8O89110 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Casp8O89110 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casp8O89110 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp8O89110 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Casp8O89110 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Casp8O89110 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Casp8O89110 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Casp8O89110 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casp8O89110 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp8O89110 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Casp8O89110 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp8O89110 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Casp8O89110 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Casp8O89110 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casp8O89110 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Casp8O89110 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Casp8O89110 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Casp8O89110 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Casp8O89110 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Casp8O89110 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Casp8O89110 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Casp8O89110 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Casp8O89110 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casp8O89110 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casp8O89110 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casp8O89110 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casp8O89110 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casp8O89110 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casp8O89110 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Casp8O89110 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casp8O89110 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casp8O89110 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Casp8O89110 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Casp8O89110 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casp8O89110 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casp8O89110 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Casp8O89110 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casp8O89110 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casp8O89110 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Casp8O89110 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Casp8O89110 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casp8O89110 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Casp8O89110 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Casp8O89110 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Casp8O89110 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Casp8O89110 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casp8O89110 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casp8O89110 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casp8O89110 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casp8O89110 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casp8O89110 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casp8O89110 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casp8O89110 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp8O89110 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Casp8O89110 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp8O89110 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casp8O89110 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casp8O89110 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp8O89110 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casp8O89110 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casp8O89110 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Casp8O89110 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casp8O89110 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casp8O89110 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casp8O89110 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casp8O89110 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp8O89110 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casp8O89110 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casp8O89110 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casp8O89110 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Casp8O89110 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Casp8O89110 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Casp8O89110 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casp8O89110 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp8O89110 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casp8O89110 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casp8O89110 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casp8O89110 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms